298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1384 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
411 aa  826    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  77.02 
 
 
422 aa  631  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12000  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  76.05 
 
 
418 aa  622  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  72.24 
 
 
409 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  67.8 
 
 
417 aa  548  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  65.6 
 
 
414 aa  528  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0280  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  67.56 
 
 
410 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3141  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.43 
 
 
410 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.69 
 
 
417 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.39 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  51.59 
 
 
409 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1041  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.41 
 
 
458 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2436  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  47.37 
 
 
427 aa  362  9e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.02 
 
 
379 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.59 
 
 
378 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.3 
 
 
379 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4670  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.15 
 
 
418 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.68 
 
 
379 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.76 
 
 
379 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.39 
 
 
401 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  36.97 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.64 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.84 
 
 
380 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.84 
 
 
380 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.3 
 
 
385 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.98 
 
 
386 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.4 
 
 
381 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3713  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.56 
 
 
382 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.628377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2117  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  40.8 
 
 
381 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1020  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.7 
 
 
372 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168014  normal  0.586617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.53 
 
 
385 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  39.89 
 
 
386 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  41.5 
 
 
394 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.24 
 
 
381 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.57 
 
 
403 aa  259  8e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0068  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.63 
 
 
382 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368436  normal  0.0189918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.72 
 
 
378 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3514  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.45 
 
 
381 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.8 
 
 
387 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.44 
 
 
397 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  37.8 
 
 
387 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.98 
 
 
391 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.43 
 
 
387 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.32 
 
 
397 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  38.46 
 
 
390 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.2 
 
 
406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  38.15 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  38.15 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.88 
 
 
383 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.52 
 
 
399 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.5 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.17 
 
 
387 aa  252  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.04 
 
 
388 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.3 
 
 
391 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3333  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.53 
 
 
381 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0889608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5250  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.53 
 
 
381 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5034  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.53 
 
 
381 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.19 
 
 
381 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.77 
 
 
415 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 
381 aa  249  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 
381 aa  249  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1661  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.52 
 
 
415 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448458  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.93 
 
 
390 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.14 
 
 
381 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.01 
 
 
405 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.67 
 
 
390 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.28 
 
 
402 aa  246  6e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0085  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.36 
 
 
382 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.01 
 
 
402 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5475  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.14 
 
 
396 aa  245  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.08 
 
 
390 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.27 
 
 
390 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1846  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.7 
 
 
382 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2990  putative L-lactate dehydrogenase  39.02 
 
 
380 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181146  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0374  L-lactate dehydrogenase  39.02 
 
 
380 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0688982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2872  putative L-lactate dehydrogenase  39.02 
 
 
380 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279679  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0415  L-lactate dehydrogenase  39.02 
 
 
380 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.596015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1229  L-lactate dehydrogenase  39.02 
 
 
380 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0499523  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.72 
 
 
357 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1563  L-lactate dehydrogenase  39.02 
 
 
380 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1750  L-lactate dehydrogenase  39.02 
 
 
380 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3487  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.99 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323095  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.94 
 
 
381 aa  239  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  37.74 
 
 
379 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50804  glycolate oxidase  36.39 
 
 
431 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114627  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0762  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.17 
 
 
400 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.5 
 
 
406 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7084  dehydrogenase  37.14 
 
 
392 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3178  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.9 
 
 
414 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3174  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.13 
 
 
399 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.898854  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.96 
 
 
383 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  36.91 
 
 
440 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  36.91 
 
 
440 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35 
 
 
387 aa  236  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  38.96 
 
 
392 aa  236  8e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.34 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  34.03 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  38.24 
 
 
386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  37.28 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1660  FMN-dependent dehydrogenase  36.66 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>