More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4877 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4877  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 379 aa  756    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.414226 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5475  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.32 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.68 
 
 		 401 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  42.55 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.16 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  42.06 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  41.64 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  41.64 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  41.64 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.09 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.68 
 
 		 357 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  40.59 
 
 		 394 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  42.25 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  41.64 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.96 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  40.97 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  40.97 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  40.97 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.97 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  40.97 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  40.97 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  40.97 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  40.97 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  40.97 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.56 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  40.32 
 
 		 379 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.87 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.61 
 
 		 379 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.57 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  40.59 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.34 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.19 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.89 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.01 
 
 		 379 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2077  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.37 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.07 
 
 		 379 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.19 
 
 		 402 aa  245  9e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  40.71 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  40.59 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  40.44 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.93 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  39.89 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.97 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.5 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.19 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0107  putative FMN-dependent dehydrogenase  39.3 
 
 		 420 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0219  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.66 
 
 		 387 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.65 
 
 		 390 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0254  L-lactate dehydrogenase  40.21 
 
 		 378 aa  243  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4018  L-lactate dehydrogenase  40.59 
 
 		 396 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.75 
 
 		 380 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.35 
 
 		 378 aa  242  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4080  L-lactate dehydrogenase  40.59 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3911  L-lactate dehydrogenase  40.59 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  38.96 
 
 		 381 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  38.96 
 
 		 381 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  40.59 
 
 		 396 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.57 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.4 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.3 
 
 		 381 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.57 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.27 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0695  L-lactate dehydrogenase  40.05 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.39 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.16 
 
 		 388 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  39.84 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3973  L-lactate dehydrogenase  40.32 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.29 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3487  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.6 
 
 		 383 aa  239  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323095  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4736  L-lactate dehydrogenase  39.78 
 
 		 381 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4602  L-lactate dehydrogenase  39.78 
 
 		 381 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515412  normal  0.0177303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.5 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3178  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.06 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0283  FMN-dependent dehydrogenase  39.57 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0882  FMN-dependent dehydrogenase  39.57 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726266  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.14 
 
 		 415 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2444  FMN-dependent dehydrogenase  39.57 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0130  L-lactate dehydrogenase  40.05 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.57 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0468  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.56 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000798916  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  39.57 
 
 		 440 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  39.57 
 
 		 440 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  38.67 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3855  L-lactate dehydrogenase  41.76 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1831  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.56 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  39.52 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1660  FMN-dependent dehydrogenase  39.3 
 
 		 440 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.77 
 
 		 387 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1661  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.54 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448458  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.81 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  37.77 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  37.5 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.98 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  40.59 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  38.24 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.87 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3045  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.57 
 
 		 374 aa  232  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.01 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.36 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1708  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.48 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  0.602463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>