More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3045 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3045  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 
374 aa  743    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3174  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.85 
 
 
399 aa  281  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.898854  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1403  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.48 
 
 
368 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00336342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2622  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.75 
 
 
398 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737171  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6402  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.15 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.84 
 
 
380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.78 
 
 
401 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1020  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  45.6 
 
 
372 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168014  normal  0.586617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  42.06 
 
 
394 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.54 
 
 
397 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.07 
 
 
380 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.3 
 
 
391 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.34 
 
 
386 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.28 
 
 
381 aa  258  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  39.28 
 
 
381 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  39.28 
 
 
381 aa  258  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.55 
 
 
378 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.67 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2778  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.96 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.985117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.71 
 
 
409 aa  252  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.94 
 
 
391 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.21 
 
 
405 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  38.16 
 
 
386 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1708  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.21 
 
 
395 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  0.602463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  37.85 
 
 
387 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.85 
 
 
387 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.11 
 
 
357 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.72 
 
 
390 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7084  dehydrogenase  40.43 
 
 
392 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4469  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.24 
 
 
395 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0508385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.5 
 
 
390 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5045  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  45.43 
 
 
394 aa  246  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.5 
 
 
390 aa  245  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2484  cytochrome containing L-lactate dehydrogenase  40.58 
 
 
389 aa  245  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.89 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1661  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.95 
 
 
415 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  39.67 
 
 
383 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.89 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5798  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.43 
 
 
415 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.64 
 
 
406 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.69 
 
 
388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.74 
 
 
387 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  39.39 
 
 
383 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.02 
 
 
383 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.4 
 
 
385 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.07 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.89 
 
 
381 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.05 
 
 
411 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.64 
 
 
383 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2026  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.67 
 
 
389 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3410  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.02 
 
 
435 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194367  hitchhiker  0.0000661899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.24 
 
 
422 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0789  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.15 
 
 
431 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.84 
 
 
415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4230  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.72 
 
 
389 aa  235  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.98 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.71 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0219  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.47 
 
 
387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.93 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5062  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.02 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.580751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.81 
 
 
385 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0228  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  40.48 
 
 
439 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  36.78 
 
 
380 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  39 
 
 
409 aa  232  7.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  35.91 
 
 
381 aa  232  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0283  FMN-dependent dehydrogenase  35.65 
 
 
412 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0882  FMN-dependent dehydrogenase  35.65 
 
 
412 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2444  FMN-dependent dehydrogenase  35.65 
 
 
412 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  36.64 
 
 
386 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  35.65 
 
 
440 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  35.65 
 
 
440 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4877  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.57 
 
 
379 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.414226 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  35.65 
 
 
412 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  35.1 
 
 
390 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.55 
 
 
397 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4248  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.33 
 
 
397 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0525858  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1660  FMN-dependent dehydrogenase  35.38 
 
 
440 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.47 
 
 
388 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.44 
 
 
387 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.52 
 
 
390 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3178  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.21 
 
 
414 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.87 
 
 
379 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.68 
 
 
379 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  38.65 
 
 
384 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  37.19 
 
 
386 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4670  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.95 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0762  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.36 
 
 
400 aa  226  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  36.41 
 
 
399 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.43 
 
 
379 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.19 
 
 
379 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2344  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.71 
 
 
395 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2810  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.33 
 
 
382 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.52 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0579  FMN-dependent dehydrogenase  34.54 
 
 
412 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0360  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.93 
 
 
370 aa  222  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1871  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.34 
 
 
358 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.44 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3487  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.22 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323095  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1563  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0415  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.596015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>