More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5798 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5798  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
415 aa  825    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100702 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0717  FMN-dependent family dehydrogenase  67.73 
 
 
447 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1565  FMN-dependent family dehydrogenase  67.73 
 
 
407 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2038  FMN-dependent family dehydrogenase  67.73 
 
 
441 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0604  putative L(+)-mandelate dehydrogenase  67.73 
 
 
441 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0813  FMN-dependent family dehydrogenase  67.2 
 
 
407 aa  494  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2112  FMN-dependent family dehydrogenase  67.73 
 
 
447 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2199  FMN-dependent family dehydrogenase  67.73 
 
 
441 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1696  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  66.67 
 
 
405 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320518  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0789  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  64.19 
 
 
431 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7084  dehydrogenase  60.79 
 
 
392 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1708  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.4 
 
 
395 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  0.602463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1661  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62.34 
 
 
415 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448458  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4469  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  61.74 
 
 
395 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0508385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.29 
 
 
411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3410  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.57 
 
 
435 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194367  hitchhiker  0.0000661899 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0228  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  54.29 
 
 
439 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2428  putative L-lactate dehydrogenase  46.61 
 
 
396 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.02 
 
 
412 aa  292  9e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.89 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1020  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.12 
 
 
372 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168014  normal  0.586617 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5475  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.53 
 
 
396 aa  256  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.74 
 
 
415 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3174  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.71 
 
 
399 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.898854  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.5 
 
 
357 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3045  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.43 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  36.34 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  39.08 
 
 
394 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6402  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.69 
 
 
402 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.5 
 
 
385 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.76 
 
 
409 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2622  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.45 
 
 
398 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737171  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  36.25 
 
 
397 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4877  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 
379 aa  229  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.414226 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5045  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  41.19 
 
 
394 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.46 
 
 
380 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  37.27 
 
 
379 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  33.93 
 
 
381 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1846  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.34 
 
 
382 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0068  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.34 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368436  normal  0.0189918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3514  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.2 
 
 
381 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.56 
 
 
380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
383 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  37.1 
 
 
381 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  37.1 
 
 
381 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  37.1 
 
 
381 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.5 
 
 
397 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  33.25 
 
 
381 aa  219  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  33.25 
 
 
381 aa  219  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.54 
 
 
406 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.46 
 
 
379 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  36.76 
 
 
386 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  35.81 
 
 
386 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.98 
 
 
386 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
383 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.3 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  35.34 
 
 
386 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3713  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.77 
 
 
382 aa  217  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.628377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.25 
 
 
381 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4230  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.17 
 
 
389 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.16 
 
 
381 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
379 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.04 
 
 
359 aa  216  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.13 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2344  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.58 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.27 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0107  putative FMN-dependent dehydrogenase  35.71 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  35.96 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3487  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.53 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323095  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  38.17 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.68 
 
 
390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.55 
 
 
388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2436  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.85 
 
 
427 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3141  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.55 
 
 
410 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.03 
 
 
417 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  36.91 
 
 
378 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1403  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.68 
 
 
368 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00336342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  34.31 
 
 
387 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1050  L-lactate dehydrogenase  36.17 
 
 
381 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2810  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.64 
 
 
382 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.31 
 
 
387 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
381 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  36.31 
 
 
392 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2026  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.8 
 
 
389 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37 
 
 
379 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.1 
 
 
405 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.94 
 
 
402 aa  207  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4248  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.36 
 
 
397 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0525858  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.38 
 
 
385 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0668  (S)-mandelate dehydrogenase  37.33 
 
 
391 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.68 
 
 
402 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.6 
 
 
387 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
383 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  37 
 
 
381 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  32.73 
 
 
390 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.59 
 
 
417 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5250  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.67 
 
 
381 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3333  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  34.67 
 
 
381 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0889608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5034  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  34.67 
 
 
381 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  35.45 
 
 
396 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>