More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5920 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  58.29 
 
 		 234 aa  220  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  57.87 
 
 		 198 aa  214  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  60.91 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  58.59 
 
 		 229 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  58.59 
 
 		 260 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  58.59 
 
 		 260 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  58.08 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  58.08 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  58.08 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  58.08 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  55.56 
 
 		 197 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  55.56 
 
 		 197 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  45.36 
 
 		 220 aa  148  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  41.12 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  41.18 
 
 		 232 aa  144  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  42.71 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  43.81 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  46.63 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  40.21 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  39.49 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  44.44 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  39.5 
 
 		 228 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  37.24 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  42.08 
 
 		 283 aa  130  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  40.96 
 
 		 273 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  39.69 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  37.82 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  39.29 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  53.97 
 
 		 155 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  39.18 
 
 		 276 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  39.09 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  37.56 
 
 		 444 aa  98.6  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 249 aa  98.2  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  36.52 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  27.45 
 
 		 247 aa  95.5  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  32.71 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  27.32 
 
 		 258 aa  92.8  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  36.5 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  29 
 
 		 241 aa  92.8  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  39.44 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  32.68 
 
 		 222 aa  92  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  40.36 
 
 		 285 aa  91.7  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  33.18 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  35.41 
 
 		 291 aa  88.6  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  38.67 
 
 		 241 aa  88.2  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  32.06 
 
 		 246 aa  88.2  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  34.17 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  38 
 
 		 263 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  33.98 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  33.96 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  37.82 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  32.2 
 
 		 231 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  35.89 
 
 		 252 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  36.6 
 
 		 238 aa  84.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  28.69 
 
 		 259 aa  84.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  31.75 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  32.74 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  33.71 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  34.46 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  32.52 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  37.66 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  32.14 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  32.41 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  36.97 
 
 		 362 aa  82  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  32.29 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  33.96 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  35.06 
 
 		 247 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  32.54 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  34.62 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  36.95 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  33.66 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  32.21 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  32.55 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  38.46 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  37.01 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  37.58 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  37.58 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  35.48 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  32.35 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  34.21 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  36 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  36.94 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  33.57 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  28.43 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  36.31 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  29.72 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  31 
 
 		 360 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  34.64 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  31 
 
 		 360 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  31.31 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  44.71 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  35.05 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  28.91 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  35.1 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  31.16 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  34.18 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>