More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  100 
 
 
579 aa  1143    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  38.38 
 
 
570 aa  276  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  35.73 
 
 
715 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  35.19 
 
 
565 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  34.99 
 
 
708 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  31.17 
 
 
552 aa  233  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  36.45 
 
 
580 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  36.42 
 
 
1652 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  32.86 
 
 
560 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  32.73 
 
 
580 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  31.34 
 
 
552 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  35.75 
 
 
614 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  31.16 
 
 
592 aa  194  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  32.98 
 
 
674 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  32.22 
 
 
899 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 
532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  30.7 
 
 
575 aa  181  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  30.08 
 
 
569 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  35.37 
 
 
665 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  30.81 
 
 
598 aa  177  6e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  30.56 
 
 
559 aa  171  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  31.36 
 
 
534 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  32.96 
 
 
657 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  30.24 
 
 
627 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  32.02 
 
 
1184 aa  164  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  29.57 
 
 
610 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 
526 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  28.75 
 
 
621 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  30.07 
 
 
1219 aa  156  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
568 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  29.78 
 
 
521 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  29.81 
 
 
546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  31.34 
 
 
1217 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  31.64 
 
 
533 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  34.49 
 
 
1224 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  30 
 
 
535 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  31.4 
 
 
1209 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 
1263 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  30.85 
 
 
1168 aa  133  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  30.85 
 
 
1184 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  29.6 
 
 
918 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  25.94 
 
 
1219 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  26.74 
 
 
513 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  26.74 
 
 
513 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  24.87 
 
 
521 aa  91.3  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  25.34 
 
 
529 aa  90.1  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 
521 aa  87.8  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25.53 
 
 
521 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  25.62 
 
 
526 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  24.96 
 
 
523 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  24.4 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  26.23 
 
 
539 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 
522 aa  83.6  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  24.58 
 
 
515 aa  83.2  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  25.49 
 
 
543 aa  82.4  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  24.36 
 
 
515 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
528 aa  82  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  24.32 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.82 
 
 
522 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.14 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.14 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  24.83 
 
 
513 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0865  virulence factor MVIN family protein  28.41 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156001  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  27.09 
 
 
524 aa  80.9  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  21.67 
 
 
494 aa  80.5  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  25.84 
 
 
511 aa  80.5  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
524 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  24.01 
 
 
538 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
524 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
524 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  24.79 
 
 
511 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.74 
 
 
511 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
524 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
524 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  24.58 
 
 
537 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 
522 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  24.35 
 
 
521 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0625  virulence factor MVIN family protein  30.33 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.289297  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  25.64 
 
 
526 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  24.51 
 
 
539 aa  77.4  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  27.09 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  23.93 
 
 
522 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  23.33 
 
 
525 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  21.29 
 
 
523 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  27.86 
 
 
552 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  25 
 
 
517 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  26.57 
 
 
521 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  25.25 
 
 
515 aa  75.5  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  25.81 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
534 aa  74.3  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  27.62 
 
 
541 aa  74.3  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>