More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0625 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0865  virulence factor MVIN family protein  81.94 
 
 		 444 aa  690    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0625  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 		 448 aa  862    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.289297  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0035  virulence factor MVIN family protein  42.4 
 
 		 468 aa  286  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 		 511 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  30.11 
 
 		 534 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  30.39 
 
 		 511 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  30.32 
 
 		 521 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 		 522 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  36.77 
 
 		 535 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  29.4 
 
 		 613 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  36.69 
 
 		 535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 		 529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  35.47 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  29.49 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.91 
 
 		 523 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  33.07 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 		 542 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  29.53 
 
 		 511 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  29.86 
 
 		 511 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 		 511 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  29.41 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  30.71 
 
 		 513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  31.55 
 
 		 512 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  31.55 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  31.7 
 
 		 524 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 524 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 524 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 524 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 524 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 524 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  28.67 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  28.67 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  31.28 
 
 		 512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 501 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  31.02 
 
 		 512 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  29.87 
 
 		 521 aa  136  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  30.37 
 
 		 522 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  34.26 
 
 		 541 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  31.14 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  31.47 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  31.47 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  30.26 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  32.09 
 
 		 512 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  31.68 
 
 		 526 aa  134  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  30.36 
 
 		 521 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  31.82 
 
 		 512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  33.42 
 
 		 543 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  30.83 
 
 		 513 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  31.9 
 
 		 534 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 		 530 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  28.77 
 
 		 522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  26.08 
 
 		 539 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  29.27 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  29.29 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  30.85 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  27.68 
 
 		 529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  31.98 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  26.97 
 
 		 531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 		 530 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  30.3 
 
 		 538 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  31.12 
 
 		 517 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  31.41 
 
 		 517 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  29.53 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  27.78 
 
 		 520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1590  integral membrane protein MviN  29.08 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.814029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  30.57 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  32.35 
 
 		 528 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  27.15 
 
 		 512 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  28.42 
 
 		 508 aa  126  7e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  25.95 
 
 		 495 aa  126  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  29.97 
 
 		 511 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 		 525 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  31.18 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 		 512 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  28.44 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  27.39 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  28.81 
 
 		 512 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  26.81 
 
 		 518 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.79 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  27.72 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 		 528 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  27.15 
 
 		 516 aa  123  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3190  integral membrane protein MviN  30.84 
 
 		 599 aa  123  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000159661  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  31.08 
 
 		 573 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  27.74 
 
 		 534 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  30.42 
 
 		 521 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  31.5 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>