250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31300 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  100 
 
 
234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  55.2 
 
 
224 aa  251  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  53.42 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  54.5 
 
 
230 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  54.34 
 
 
228 aa  228  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  52.65 
 
 
229 aa  227  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  53.88 
 
 
232 aa  225  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  49.37 
 
 
248 aa  224  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  52.42 
 
 
240 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  52.42 
 
 
240 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  52.42 
 
 
240 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  52.89 
 
 
226 aa  222  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  50.43 
 
 
242 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.12 
 
 
237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  50.67 
 
 
237 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  53.08 
 
 
251 aa  215  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  54.46 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.63 
 
 
238 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.82 
 
 
233 aa  194  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  46.79 
 
 
227 aa  191  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  45.25 
 
 
226 aa  186  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  45.16 
 
 
229 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  48.09 
 
 
227 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.7 
 
 
220 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.07 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  36.53 
 
 
217 aa  165  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  39.02 
 
 
218 aa  161  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  38.32 
 
 
220 aa  159  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.11 
 
 
221 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  39.19 
 
 
230 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.92 
 
 
227 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  37.77 
 
 
237 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  33.98 
 
 
235 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.89 
 
 
235 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.63 
 
 
226 aa  148  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  33 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.73 
 
 
218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.45 
 
 
225 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  32.26 
 
 
218 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  37.31 
 
 
223 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  32.26 
 
 
217 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  37.61 
 
 
222 aa  141  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.5 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.16 
 
 
214 aa  139  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.55 
 
 
232 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  41.27 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.5 
 
 
234 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.58 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  34.74 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  31.75 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 
229 aa  125  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.4 
 
 
236 aa  125  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  39.27 
 
 
239 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.1 
 
 
240 aa  121  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.77 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.07 
 
 
241 aa  118  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30.84 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.44 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.5 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  35.52 
 
 
214 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  35.52 
 
 
214 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.69 
 
 
214 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  31.32 
 
 
217 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  34.43 
 
 
214 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  37.88 
 
 
310 aa  99.8  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.1 
 
 
219 aa  99  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.52 
 
 
237 aa  98.6  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.5 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  35.9 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.36 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.74 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  27.01 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.85 
 
 
161 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  33.85 
 
 
134 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  35.38 
 
 
148 aa  92.8  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  38.28 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  35.29 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  33.85 
 
 
134 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  33.85 
 
 
134 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  33.85 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.47 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.61 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.82 
 
 
239 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  35.29 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  35.29 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  35.29 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.33 
 
 
231 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  35.88 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  36.09 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.47 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  36.09 
 
 
229 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  32.18 
 
 
231 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.28 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.84 
 
 
228 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.63 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  33.33 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  30.2 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.46 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  31.16 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>