More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17670 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  100 
 
 		 566 aa  1084    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  48.06 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  47.28 
 
 		 829 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  46.98 
 
 		 581 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  39.19 
 
 		 624 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2781  sodium/hydrogen exchanger  58.33 
 
 		 601 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.392018  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  39.93 
 
 		 624 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  39.35 
 
 		 621 aa  266  8.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  37.39 
 
 		 623 aa  256  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  39.59 
 
 		 624 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  31.57 
 
 		 531 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  35.83 
 
 		 564 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  35.02 
 
 		 537 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  30.04 
 
 		 534 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  35.69 
 
 		 626 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  32.51 
 
 		 525 aa  213  9e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  30.73 
 
 		 533 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  36.2 
 
 		 533 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 536 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  35.97 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  35.97 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  31.83 
 
 		 537 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  36.89 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  32.43 
 
 		 535 aa  206  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 		 425 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  37.95 
 
 		 568 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 		 560 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 		 560 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 		 560 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.84 
 
 		 524 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  34.56 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 423 aa  193  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  31.65 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4050  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 562 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553254  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  30.07 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  29.1 
 
 		 524 aa  190  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  33.86 
 
 		 524 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  27.43 
 
 		 532 aa  188  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.07 
 
 		 537 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  34.96 
 
 		 534 aa  186  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  27.26 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  36.44 
 
 		 531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  35.11 
 
 		 535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  35.11 
 
 		 535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  34.42 
 
 		 524 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  34.02 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  32.39 
 
 		 535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  33.79 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  33.79 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  35.21 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  33.79 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  33.79 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  33.79 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.83 
 
 		 527 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.9 
 
 		 528 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  32.84 
 
 		 550 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  33.56 
 
 		 526 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  33.47 
 
 		 531 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  33.53 
 
 		 527 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  44.93 
 
 		 556 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  28.84 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 526 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  34.73 
 
 		 533 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  26.97 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  33.01 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  33.61 
 
 		 550 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 		 488 aa  170  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  34.42 
 
 		 553 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  39.07 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 526 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 526 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  32.27 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  30.75 
 
 		 526 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 526 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  33.72 
 
 		 525 aa  160  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 		 525 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  32.54 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  32.54 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  32.54 
 
 		 527 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 		 511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  32.81 
 
 		 538 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  31.86 
 
 		 526 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  33.75 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  32.59 
 
 		 523 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2436  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 		 495 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0140335  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  33.1 
 
 		 555 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  33.1 
 
 		 555 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  40.36 
 
 		 527 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  40 
 
 		 527 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  29.23 
 
 		 563 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  29.23 
 
 		 563 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  29.23 
 
 		 563 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  29.23 
 
 		 563 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  29.23 
 
 		 548 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  32.22 
 
 		 633 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>