More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5150 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  99.44 
 
 		 356 aa  703    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  99.44 
 
 		 356 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  100 
 
 		 356 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  75 
 
 		 355 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  74.44 
 
 		 355 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  74.51 
 
 		 356 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  58.5 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  57.18 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  55.21 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  56.18 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  52.2 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  50.42 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  52.06 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  52.06 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  51.59 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  41.53 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  41.27 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  36.91 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  36.64 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  33.09 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  35.5 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  38.4 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  34.08 
 
 		 375 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  34.08 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  34.08 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  34.08 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  34.08 
 
 		 379 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  34.08 
 
 		 391 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  34.54 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  35 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  34.93 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  34.82 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  35.28 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  35.28 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  35.12 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  35.58 
 
 		 368 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  32.63 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  33.7 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  36.24 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  36.24 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  32.63 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  34.34 
 
 		 374 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  33.62 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  37.75 
 
 		 386 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  36.75 
 
 		 380 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  34.73 
 
 		 357 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  33.33 
 
 		 390 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  36.75 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  37.39 
 
 		 384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.11 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  33.68 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  34.34 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  34.17 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.4 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  34.57 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  32.98 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  34.17 
 
 		 356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  34.17 
 
 		 356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  34.04 
 
 		 390 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  31.84 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  31.84 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  31.84 
 
 		 449 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  31.65 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  31.65 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  31.65 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  30.52 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  33.25 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  34.46 
 
 		 376 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  35.48 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  34.04 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  35.95 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  35.48 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  35.48 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  34.04 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  33 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  33 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  35.84 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  37.04 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  36.69 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  34.85 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  32.47 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  34.58 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  32.5 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  32.98 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  34.04 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  33.67 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  34.26 
 
 		 374 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  33.52 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  32.5 
 
 		 386 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  36.6 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  33.79 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.56 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  32.6 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  34.38 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  33.67 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  33.82 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  33.5 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.69 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  33.94 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  32.94 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>