126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4651 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 243 aa  477  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 243 aa  477  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  97.53 
 
 		 243 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  76.25 
 
 		 264 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  76.03 
 
 		 244 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  75.41 
 
 		 244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  76.23 
 
 		 244 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  76.15 
 
 		 349 aa  344  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  76.15 
 
 		 244 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  75.73 
 
 		 244 aa  340  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  70.78 
 
 		 245 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  71.07 
 
 		 273 aa  330  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  70.04 
 
 		 250 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  64.14 
 
 		 277 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  67.24 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  62.96 
 
 		 247 aa  289  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  60.42 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  45 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  54.59 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  51.08 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  45.1 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  47.96 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  43.68 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  39.33 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  36.1 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.93 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  27.17 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.14 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  28.26 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  26.05 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  27.18 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  27.18 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  29.55 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  22.11 
 
 		 286 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  28.99 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 266 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  22.11 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  24.51 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  28.83 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  32.04 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  26.36 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  25.32 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  23.11 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  28.08 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 294 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  26.8 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1025  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  26.61 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6380  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6613  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0305717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  27.22 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.52 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.36 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6211  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  25.38 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  24.4 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  25.38 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  25.38 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2482  extracellular solute-binding protein family 3  27.74 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000146817 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  23.56 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  26.22 
 
 		 304 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  29.1 
 
 		 270 aa  45.4  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 1080 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  27.27 
 
 		 472 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  22.67 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.3 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  27.54 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.75 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3868  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 294 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  23.26 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4864  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950459 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  22.09 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>