123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5067 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  100 
 
 		 313 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  96.49 
 
 		 313 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  89.7 
 
 		 322 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  89.74 
 
 		 320 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  87.75 
 
 		 319 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  87.75 
 
 		 319 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  53.85 
 
 		 314 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  44.41 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  43.73 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  40.54 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  34.12 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  37.58 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  36.93 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  37.92 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  35.88 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  37.12 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  38.41 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  35.12 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  35.12 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  36.33 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  36.33 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  36.33 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  35.33 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  32.68 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  31.61 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  29.8 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  29.45 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  30.39 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  32.11 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  27.67 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  32.21 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  30.74 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  28.12 
 
 		 387 aa  96.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  31.83 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  31.51 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  30.43 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  31.19 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  31.19 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  30.9 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  30.23 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  27.69 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 274 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  28.23 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  33.78 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  29.18 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  31.76 
 
 		 278 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  32.34 
 
 		 261 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  30.84 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  28.38 
 
 		 276 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  28.43 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  28.38 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  34.48 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  28.41 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  27.39 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  29.5 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  29.68 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  22.9 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  31.07 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  22.12 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  33 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  27 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  28 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  31.88 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  27.35 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  27.65 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  29.77 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  22.82 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  31.33 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  31.63 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  23.98 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  26.65 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  31.31 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  31.31 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  29.28 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  29.21 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>