More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1206 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  860    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.59 
 
 		 442 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  66.37 
 
 		 442 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  67.57 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  63.38 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  61.5 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  62.65 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  60.64 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  53.08 
 
 		 439 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  60.38 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  53.33 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  53.33 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  53.88 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  48.1 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  47.87 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  48.1 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  48.1 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  46.43 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  47.87 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  46.43 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 449 aa  356  5e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 		 455 aa  352  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  42.45 
 
 		 428 aa  343  5e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 450 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 442 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 450 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 442 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  41.12 
 
 		 455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.69 
 
 		 440 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.88 
 
 		 432 aa  302  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  45.79 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 456 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  45.55 
 
 		 443 aa  299  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 442 aa  299  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  40.62 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3119  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 448 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 441 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 428 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 		 432 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 441 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 441 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  41.84 
 
 		 447 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 448 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 448 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 444 aa  289  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.38 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.82 
 
 		 469 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  40.82 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  40.82 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  39.45 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  40.82 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  40.82 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  40.82 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 459 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>