203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0738 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
356 aa  724    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  99.72 
 
 
356 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1891  pentapeptide repeat-containing protein  91.01 
 
 
356 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
356 aa  724    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
356 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  99.72 
 
 
356 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  99.72 
 
 
356 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
356 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0798  hypothetical protein  24.09 
 
 
738 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  19.66 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  19.66 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  23.9 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1892  hypothetical protein  23.76 
 
 
716 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  23.01 
 
 
880 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  23.01 
 
 
880 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  23.9 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  23.01 
 
 
880 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  23.01 
 
 
880 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0447  hypothetical protein  23.76 
 
 
543 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414119  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  23.9 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2083  hypothetical protein  23.76 
 
 
738 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0739  hypothetical protein  23.76 
 
 
738 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  23.9 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1034  hypothetical protein  23.76 
 
 
738 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  23.9 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  22.96 
 
 
880 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0710  hypothetical protein  23.76 
 
 
738 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2008  hypothetical protein  23.76 
 
 
738 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  20.36 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  23.88 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  22.42 
 
 
877 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  20.47 
 
 
739 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  21.16 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  20.47 
 
 
739 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  20.47 
 
 
739 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  20.65 
 
 
191 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 
206 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  22.06 
 
 
343 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  22.07 
 
 
285 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  21.88 
 
 
349 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  20.32 
 
 
976 aa  59.7  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  21.6 
 
 
862 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  26.59 
 
 
250 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  21.97 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  29.03 
 
 
447 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 
197 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  30.07 
 
 
229 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  19.59 
 
 
401 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  19.59 
 
 
401 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  27.23 
 
 
311 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  21.02 
 
 
401 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  21.48 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  21.86 
 
 
881 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  21.61 
 
 
844 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  22.48 
 
 
452 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  22.39 
 
 
199 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  21.02 
 
 
401 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  24.77 
 
 
872 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  27.89 
 
 
197 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.99 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  24.24 
 
 
846 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  25.57 
 
 
196 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  22.71 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  21.28 
 
 
220 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  21.51 
 
 
408 aa  53.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  22.55 
 
 
348 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  18.15 
 
 
601 aa  53.1  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  24.9 
 
 
233 aa  53.1  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  30.43 
 
 
214 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 
521 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 
266 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  18.79 
 
 
227 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  20.69 
 
 
872 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  21.32 
 
 
220 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.49 
 
 
332 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  26.19 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  26.83 
 
 
165 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  23.62 
 
 
278 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  20.08 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  21.48 
 
 
225 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  27.89 
 
 
903 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  30.09 
 
 
205 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  20.59 
 
 
220 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  26.57 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  26.57 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 
198 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
449 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 
312 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  20.11 
 
 
205 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  20.73 
 
 
213 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  21.51 
 
 
567 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 
949 aa  50.1  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  24.76 
 
 
340 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  21.24 
 
 
358 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  23.03 
 
 
273 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  21.58 
 
 
351 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  24.09 
 
 
447 aa  49.7  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  21.38 
 
 
866 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  20.69 
 
 
213 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>