189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1126 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  33.85 
 
 
271 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  32.97 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  31.23 
 
 
271 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  31.02 
 
 
276 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  34.9 
 
 
271 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  30.42 
 
 
275 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  29.44 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  32.84 
 
 
271 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  37.13 
 
 
193 aa  113  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  30.5 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  29.6 
 
 
275 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  30.9 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.92 
 
 
269 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.78 
 
 
274 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  33.58 
 
 
270 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  30.68 
 
 
275 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  31.75 
 
 
274 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  28.09 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  29.6 
 
 
275 aa  99  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  30.65 
 
 
290 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.46 
 
 
271 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  29.6 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  28.23 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
446 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  26.59 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.04 
 
 
276 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  26.14 
 
 
274 aa  89  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.31 
 
 
279 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  25.94 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
445 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  25.86 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.5 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.5 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.5 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  23.83 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  28.36 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.12 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 
445 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  31.03 
 
 
182 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  30.11 
 
 
179 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
178 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.71 
 
 
181 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.24 
 
 
180 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
186 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  33.33 
 
 
186 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
186 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.24 
 
 
178 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.24 
 
 
179 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.76 
 
 
178 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.76 
 
 
178 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
178 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
186 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  29.7 
 
 
178 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 
184 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  26.51 
 
 
194 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.75 
 
 
181 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.52 
 
 
178 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  27.66 
 
 
217 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
178 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
178 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  36.36 
 
 
157 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  27.66 
 
 
186 aa  52.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  26.14 
 
 
186 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  37.68 
 
 
178 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  29.01 
 
 
178 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.01 
 
 
178 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  37.31 
 
 
178 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  29.77 
 
 
190 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 
182 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.34 
 
 
182 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 
178 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  28.23 
 
 
135 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  29.79 
 
 
177 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
177 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1798  ATP synthase F1, delta subunit  23.17 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.608577  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.53 
 
 
190 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.4 
 
 
179 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  29.47 
 
 
188 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.29 
 
 
179 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  24.12 
 
 
175 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  23.66 
 
 
196 aa  49.3  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.35 
 
 
182 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  28.16 
 
 
194 aa  48.9  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.8 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
178 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
178 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.8 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.67 
 
 
186 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.82 
 
 
176 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.8 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
179 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.8 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.8 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.17 
 
 
177 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
178 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.22 
 
 
188 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  32.47 
 
 
118 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.2 
 
 
179 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>