More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7048 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  100 
 
 		 638 aa  1263    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  42.78 
 
 		 382 aa  273  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  47.41 
 
 		 376 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.98 
 
 		 362 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.36 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.56 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 		 369 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  34.85 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 378 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 		 378 aa  163  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 		 370 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 376 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 		 376 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 367 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.56 
 
 		 369 aa  142  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  36.66 
 
 		 383 aa  139  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  26.56 
 
 		 370 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  28.42 
 
 		 381 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 371 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  28.42 
 
 		 381 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0847  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 260 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 379 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 385 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0744  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 260 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0490  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 286 aa  126  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2684  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 		 267 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2778  hypothetical protein  34.26 
 
 		 285 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0394  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 260 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0876  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 260 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 		 613 aa  120  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5659  putative O-antigene/LPS export system permease protein  30.71 
 
 		 280 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0846  O-antigen export system, permease  25.91 
 
 		 256 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000568855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0782  O-antigen export system permease protein  25.91 
 
 		 256 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.325104  normal  0.0451845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2139  ABC transporter permease protein  29.76 
 
 		 267 aa  117  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.479828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0879  O-antigen export system, permease  25.61 
 
 		 256 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.17819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6709  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 		 259 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2055  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 267 aa  115  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  41.35 
 
 		 350 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3139  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 266 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.318534  normal  0.283866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 		 800 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 		 369 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0486  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 263 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1878  ABC transporter permease protein  30.43 
 
 		 271 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.725139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13817  O-antigen/lipopolysaccharide transport integral membrane protein ABC transporter rfbD  31.71 
 
 		 280 aa  109  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 377 aa  108  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  37.98 
 
 		 409 aa  107  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4323  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 289 aa  107  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0134  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 303 aa  104  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4100  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 417 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 409 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01510  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.53 
 
 		 296 aa  102  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0176682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 743 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 360 aa  101  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.71 
 
 		 426 aa  100  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 426 aa  100  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0278  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 288 aa  99.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 		 398 aa  99.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 388 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1184  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 276 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  38.21 
 
 		 411 aa  97.8  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 366 aa  97.8  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 425 aa  97.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4993  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 276 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5081  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 276 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5374  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 276 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0765  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 267 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0821  putative lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 		 287 aa  96.3  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 378 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 382 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 		 392 aa  96.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0717  O-antigen export system permease protein  26.45 
 
 		 287 aa  96.7  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 		 384 aa  97.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.77 
 
 		 404 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.9 
 
 		 409 aa  95.9  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 369 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 371 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 408 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 407 aa  96.3  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 408 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5620  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 276 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 374 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.12 
 
 		 375 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 408 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 395 aa  95.1  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 		 405 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 		 467 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 		 409 aa  94.7  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 414 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 		 420 aa  94  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 406 aa  94  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 		 420 aa  94  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.35 
 
 		 423 aa  93.6  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>