More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4450 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4450  branched chain amino acid ABC transporter permease  100 
 
 		 351 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0351  inner-membrane translocator  51.12 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3204  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.67 
 
 		 354 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.975304 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1562  inner-membrane translocator  39.09 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3018  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.322534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3320  inner-membrane translocator  42.97 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4290  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2665  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132153  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5757  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0807  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 352 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  29.17 
 
 		 375 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0128  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 393 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2248  putative membrane protein of ABC transport system  33.89 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1046  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.99 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.812032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0827  putative membrane protein of urea ABC transport system  27.83 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  27.7 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  27.41 
 
 		 376 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0054  ABC transporter related  29.17 
 
 		 604 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.61 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.21 
 
 		 620 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  31.25 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2864  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.64 
 
 		 385 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.96 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1955  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.79 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3491  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  32.09 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2988  ABC transporter inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.641521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00883  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  30.46 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1287  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.35 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5902  ABC transporter related  30.17 
 
 		 616 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656172  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3508  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1504  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.41 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7016  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.38 
 
 		 387 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.770663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4424  ABC transporter related  32.84 
 
 		 601 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.612186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1672  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.79 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4151  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 375 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3819  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 362 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1796  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 401 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4076  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.3 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0950  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 377 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  28.86 
 
 		 358 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3238  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.59 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1436  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4189  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.46 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0699  putative permease transporter transmembrane protein  30.96 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0568286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2618  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.14 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3700  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4607  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.7 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0228  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like  29.37 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.836611 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0432  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  32.62 
 
 		 582 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 652 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3316  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.32 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.852064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0785  inner-membrane translocator  31 
 
 		 394 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1990  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3129  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  30.57 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0796  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2005  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.5 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29721  putative membrane protein of urea ABC transport system  31.61 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1101  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.07 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5697  ABC transporter related  29.36 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.435877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 637 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4010  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.99 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0978  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.1 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1502  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.13 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2999  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3105  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0147  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0675175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2484  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.21 
 
 		 406 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3069  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2311  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.90856  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0429  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0908  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2178  branched-chain ABC transporter, permease protein, putative  30.25 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0730  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2050  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6071  ABC transporter related  33.61 
 
 		 615 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.461067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2563  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.589249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0878  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.57 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1395  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0992  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1773  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 389 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.874447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4186  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 388 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.35336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4012  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.03 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0110439  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3379  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1200  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.729253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2191  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.23 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4227  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.53 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.338662  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0999  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3933  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.3 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1868  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.88 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514988  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4900  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.38 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4635  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.71 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3061  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.27 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.992528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4428  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>