207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3830 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  84.11 
 
 		 365 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  84.38 
 
 		 365 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  100 
 
 		 365 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  72.73 
 
 		 362 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  71.63 
 
 		 361 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  71.35 
 
 		 362 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  71.35 
 
 		 361 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  45.18 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  46.17 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  44.63 
 
 		 362 aa  318  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  42.42 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  45.18 
 
 		 362 aa  295  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  44.9 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  44.9 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  45.75 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  41.76 
 
 		 361 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  37.88 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  35.5 
 
 		 369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  38.25 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  38.52 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  35.71 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  36.29 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  37.98 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  32.51 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  33.52 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  33.88 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  33.06 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  33.88 
 
 		 359 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  34.52 
 
 		 376 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  33.06 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  32.13 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  34.15 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  33.51 
 
 		 364 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  33.51 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  31.17 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  30.61 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  27.6 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  29.31 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  23.94 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  24.71 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 359 aa  95.9  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  25.89 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  27.17 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  28.21 
 
 		 353 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  26.09 
 
 		 356 aa  92.8  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.88 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 792 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  26.67 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  22.5 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  26.22 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  26.89 
 
 		 353 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  26.67 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  27.14 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  28.45 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  29.09 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  26.65 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  24.1 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  27.48 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  26 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  26.56 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  27 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  25.84 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  26.04 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  23.71 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.4 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  23.73 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  24.63 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  24.1 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  23.08 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  22.31 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  22.58 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  29.18 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  25.51 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  23.6 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  27.12 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.6 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  24.86 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>