More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0842 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 396 aa  804    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  53.81 
 
 		 388 aa  414  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  52.05 
 
 		 393 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  50.79 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  51.54 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  50.79 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  51.44 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  51.44 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  46.62 
 
 		 391 aa  349  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  48.28 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  47.52 
 
 		 372 aa  344  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  49.35 
 
 		 378 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  47.14 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  47.89 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  45.95 
 
 		 422 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  45.69 
 
 		 397 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  45.69 
 
 		 397 aa  328  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  46.8 
 
 		 372 aa  328  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  46.48 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  46.82 
 
 		 391 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  45.71 
 
 		 397 aa  325  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  46.25 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  42.24 
 
 		 429 aa  318  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  44.94 
 
 		 378 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  43.95 
 
 		 403 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  40.38 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  43.39 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  40.99 
 
 		 366 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  43.41 
 
 		 375 aa  275  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  39.64 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  39.18 
 
 		 375 aa  268  8.999999999999999e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  38.4 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  40.74 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  39.9 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  43.16 
 
 		 592 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  39.57 
 
 		 379 aa  245  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  39.21 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  39.95 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  39.63 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  35.96 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  39.44 
 
 		 402 aa  229  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  36.81 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  39.63 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.98 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  36.52 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  36.9 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  41.37 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  36.83 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.8 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.91 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  35.34 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  38.28 
 
 		 379 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  41.49 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 377 aa  206  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  35.73 
 
 		 365 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  36.08 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  38.83 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.2 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  34.47 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  36.13 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  36.29 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  36.29 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  34.48 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  35.2 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  37.99 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  33.86 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  34.04 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.46 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  34.65 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  37.97 
 
 		 364 aa  199  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  36.97 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  36.15 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  34.46 
 
 		 377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  32.38 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  40.84 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  36.97 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  40.71 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  36.3 
 
 		 408 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.95 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  34.87 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  36.9 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  39.48 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  36.01 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  39.22 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  39.47 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  35.12 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  35.2 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  38.56 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  32.38 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  39.14 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>