124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01498 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  82.8 
 
 		 94 aa  160  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  82.8 
 
 		 94 aa  159  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  45.65 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  48.35 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  47.25 
 
 		 95 aa  87.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  43.82 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  40 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  45.12 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  46.51 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  36.36 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  39.51 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  39.51 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  39.42 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  45.24 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  34.12 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  35.06 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  28.72 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  35.53 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  32.93 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  32.93 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  40 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  41.67 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  35.62 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  41.94 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 825 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 101 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  40.43 
 
 		 227 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 100 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 181 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>