More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  60.63 
 
 		 290 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 297 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 310 aa  232  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  33.79 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  32.65 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  32.64 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  33.68 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0297  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 307 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  34.24 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  33.56 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  32.56 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6122  transcriptional regulator AraC family  31.23 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  28.47 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1539  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  31.05 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3495  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2466  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  30.82 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6061  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  25.61 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  28.69 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5271  transcriptional regulator, AraC family  38.31 
 
 		 284 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0620952  normal  0.0372935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  27.76 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  27.76 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  27.76 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4655  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70214  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  36.88 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  27.05 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  27.05 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  27.05 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4241  transcriptional regulator, AraC family  39.55 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.82932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  27.05 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  27.05 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5055  transcriptional regulator AraC family  42.45 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3857  AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3260  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  35.46 
 
 		 278 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 299 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3605  hypothetical protein  25.1 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2574  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2210  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.423817  normal  0.20032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  38.53 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0805  AraC family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4620  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  25.44 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>