More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8278 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8278  virP  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.29 
 
 		 238 aa  151  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  39.81 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  37.75 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.3 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.14 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.95 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  36.95 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.2 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  36.1 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  37.76 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.27 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  36.95 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  33 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  35.96 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  35.96 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.96 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  32.84 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  36.1 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  32.16 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  33.99 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.88 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  30.39 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  30.29 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.86 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  30.39 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  30.29 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.86 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.39 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.39 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.81 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.96 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0258  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.691366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  25.5 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.77 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0284  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  27.49 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  25.24 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  26.85 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.15 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.998223  normal  0.137923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  25.71 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.88 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.79 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  26.85 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1575  HAD family hydrolase  24.78 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000310395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1752  HAD family hydrolase  25.65 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000718269  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.54 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  25.71 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0218  HAD superfamily hydrolase  23.36 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  26.67 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  24.52 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  23 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  25.35 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  26.75 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  25.84 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  25.47 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.8 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  24.42 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  25.79 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.15 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  25.48 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  26.75 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.75 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  26.07 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  26.75 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  26.05 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.19 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  26.32 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  26.54 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.7 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  26.75 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  25.45 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.75 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  26.07 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  24.04 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>