112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1670 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  100 
 
 		 364 aa  730    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  71.51 
 
 		 367 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  69.51 
 
 		 367 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  71.14 
 
 		 367 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  64.36 
 
 		 361 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  58.76 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  60.35 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  60.35 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  53.37 
 
 		 358 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  52 
 
 		 363 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  51.22 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  49.85 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  50.61 
 
 		 370 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  49.55 
 
 		 360 aa  295  9e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  49.42 
 
 		 359 aa  289  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  47.95 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  49.11 
 
 		 362 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  47.38 
 
 		 341 aa  275  8e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  48.61 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  47.92 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  49.4 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  48.47 
 
 		 343 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  48.66 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  41.29 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  49.28 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  44.21 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  47.88 
 
 		 382 aa  245  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  48.85 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  48.18 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  45.27 
 
 		 391 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  52.53 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  40.62 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.22 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  40.06 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  37.39 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.37 
 
 		 325 aa  220  3.9999999999999997e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  38.34 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  40.67 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  39.88 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  39.2 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  38.67 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  38.46 
 
 		 441 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  37.84 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  37.86 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  39.35 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  40.28 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  40.76 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  35.63 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  35.05 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  34.2 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  37.08 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.14 
 
 		 344 aa  173  5e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  27.43 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  26.86 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  28.28 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  27.19 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  27.64 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  24.85 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  27.64 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.59 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  24.77 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  24.16 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  26.38 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  26.23 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  26.09 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  24.23 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  27.88 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  25.07 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  27.88 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  27.88 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  27.88 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  27.88 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  27.88 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  27.59 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  27.88 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.38 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  26.59 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  23.71 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  25.63 
 
 		 411 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  25.89 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  26.52 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  27.74 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  24.04 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  27.74 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  31.09 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  24.38 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.54 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  24.04 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  24.2 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  27.44 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  26.61 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  24.2 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  26.61 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  26.83 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  29.91 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  28.44 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  23.36 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  27.53 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  26.19 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>