234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3891 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3891  photosystem I assembly protein Ycf3  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4206  TPR repeat-containing protein  91.33 
 
 		 173 aa  336  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.838663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0552  photosystem I assembly protein Ycf3  77.46 
 
 		 173 aa  284  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3996  photosystem I assembly protein Ycf3  75.72 
 
 		 173 aa  283  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00079078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4580  photosystem I assembly protein Ycf3  75.86 
 
 		 182 aa  282  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2321  photosystem I assembly protein Ycf3  71.1 
 
 		 173 aa  271  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2153  photosystem I assembly protein Ycf3  75.72 
 
 		 173 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2215  photosystem I assembly protein Ycf3  75.14 
 
 		 173 aa  263  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.167684 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2382  photosystem I assembly protein Ycf3  55.49 
 
 		 173 aa  216  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0310  photosystem I assembly protein Ycf3  51.63 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26511  photosystem I assembly protein Ycf3  56.07 
 
 		 173 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02041  photosystem I assembly protein Ycf3  49.71 
 
 		 173 aa  195  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.564797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1498  photosystem I assembly protein Ycf3  49.13 
 
 		 173 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01491  photosystem I assembly protein Ycf3  49.13 
 
 		 173 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.312993  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01461  photosystem I assembly protein Ycf3  49.71 
 
 		 173 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.611815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01601  photosystem I assembly protein Ycf3  49.13 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.487254  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01511  photosystem I assembly protein Ycf3  48.55 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0614033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0134  photosystem I assembly protein Ycf3  47.4 
 
 		 173 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 988 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.23 
 
 		 1056 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  31.65 
 
 		 782 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1238 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1550 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 1121 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  35.63 
 
 		 957 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1056 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1404 aa  52.4  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  40.7 
 
 		 1060 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 809 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 1101 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 		 828 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.26 
 
 		 1022 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 762 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 1486 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 818 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1526 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 688 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1450 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 3145 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 3172 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 1063 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.46 
 
 		 733 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 		 758 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.87 
 
 		 708 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 		 548 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 		 3301 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 605 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 843 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36 
 
 		 624 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 295 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 718 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.78 
 
 		 784 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.39 
 
 		 820 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  31.91 
 
 		 1914 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 750 aa  48.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1421 aa  48.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 1025 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 349 aa  47.8  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  39.73 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1215 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 649 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 1261 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 1186 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.97 
 
 		 2145 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.71 
 
 		 1764 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  38.36 
 
 		 992 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 550 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1138 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  32.95 
 
 		 825 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.8 
 
 		 991 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 870 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 		 358 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1611  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 339 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2413 aa  46.6  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 391 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.06 
 
 		 725 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 833 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 878 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 438 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1313 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2026  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 348 aa  45.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1285 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 750 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.87 
 
 		 1424 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 453 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.23 
 
 		 1266 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 366 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 607 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>