More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1509 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  77.84 
 
 
543 aa  895    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
539 aa  1100    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  60.04 
 
 
551 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  56.77 
 
 
551 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  56.59 
 
 
551 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  53.23 
 
 
541 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  49 
 
 
533 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
501 aa  281  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
501 aa  281  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 
501 aa  264  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  31.83 
 
 
523 aa  259  9e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 
499 aa  259  1e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  32.51 
 
 
523 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  31.83 
 
 
523 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 
529 aa  256  7e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
526 aa  254  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08861  ABC transporter substrate-binding protein  32.85 
 
 
491 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1959  ABC transporter substrate-binding protein  30.02 
 
 
535 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  30.99 
 
 
523 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0702  ABC transporter substrate-binding protein  31.21 
 
 
516 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11431  ABC transporter substrate-binding protein  29.42 
 
 
534 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.88428 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 
528 aa  243  7e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 
525 aa  238  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
545 aa  236  9e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15381  ABC transporter substrate-binding protein  30.04 
 
 
525 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.318492  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0704  ABC transporter substrate-binding protein  29.64 
 
 
525 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  29.06 
 
 
544 aa  180  5.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 
534 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3264  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 
550 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.39 
 
 
535 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 
543 aa  158  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  27.78 
 
 
551 aa  156  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2724  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
544 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.84 
 
 
541 aa  150  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 
515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.34 
 
 
505 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.92 
 
 
520 aa  144  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.14 
 
 
532 aa  144  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
510 aa  143  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
544 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.16 
 
 
510 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
540 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18040  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.53 
 
 
551 aa  140  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153909  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 
548 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.15 
 
 
540 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
523 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 
536 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
528 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.93 
 
 
509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
511 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.95 
 
 
520 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.77 
 
 
540 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  27.09 
 
 
566 aa  136  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 
523 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  23.99 
 
 
523 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  25.77 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.09 
 
 
525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.25 
 
 
526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 
495 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26 
 
 
524 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
541 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 
521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.46 
 
 
565 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
538 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  23.46 
 
 
589 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
530 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
547 aa  127  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 
502 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
525 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
551 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.68 
 
 
521 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.68 
 
 
521 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
531 aa  126  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.68 
 
 
521 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 
521 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 
512 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 
516 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
517 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
545 aa  124  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 
532 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
521 aa  124  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
489 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.5 
 
 
521 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.22 
 
 
520 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
502 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 
514 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  24.95 
 
 
531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.31 
 
 
542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.75 
 
 
502 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 
492 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 
582 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
506 aa  121  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>