More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3264 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3264  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 550 aa  1104    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  62.11 
 
 		 543 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18040  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  60.44 
 
 		 551 aa  636    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2724  extracellular solute-binding protein  60.37 
 
 		 544 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117295  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  56.66 
 
 		 544 aa  570  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  49.82 
 
 		 551 aa  535  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 		 526 aa  266  7e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 525 aa  259  7e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 529 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  30.47 
 
 		 528 aa  216  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  31.04 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 		 551 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 		 551 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 543 aa  145  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 		 551 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  24.76 
 
 		 533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.05 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 569 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 564 aa  110  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 547 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.02 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.56 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.65 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  23.32 
 
 		 519 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 532 aa  104  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.79 
 
 		 529 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 537 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 546 aa  103  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 566 aa  103  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  23.48 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.81 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.81 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 517 aa  101  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 529 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.4 
 
 		 525 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.43 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.95 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  23.79 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.43 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  23.92 
 
 		 522 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  23.53 
 
 		 525 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 529 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 521 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.8 
 
 		 525 aa  99  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 525 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.1 
 
 		 550 aa  99.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.88 
 
 		 529 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 510 aa  99.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 552 aa  98.6  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 535 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 543 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 528 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  25.75 
 
 		 529 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 515 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26 
 
 		 528 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 590 aa  97.1  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 595 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 529 aa  96.3  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.81 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.74 
 
 		 495 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.7 
 
 		 525 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 532 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 594 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 520 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  26.68 
 
 		 522 aa  94.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  25.14 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.33 
 
 		 521 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 525 aa  94  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 		 526 aa  93.6  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  27.25 
 
 		 530 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  27.25 
 
 		 530 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  27.25 
 
 		 530 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 510 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  27.25 
 
 		 530 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  27.25 
 
 		 530 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.35 
 
 		 521 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 520 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.95 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 		 516 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 610 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.48 
 
 		 525 aa  92.8  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 521 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>