More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0988 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  100 
 
 
247 aa  500  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  87.76 
 
 
242 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  72.77 
 
 
245 aa  355  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  77.25 
 
 
245 aa  354  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  77.25 
 
 
245 aa  354  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  77.02 
 
 
242 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  61.6 
 
 
243 aa  295  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  57.2 
 
 
249 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  56.12 
 
 
243 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  54.31 
 
 
289 aa  268  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  52.7 
 
 
286 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  52.59 
 
 
280 aa  264  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  53.81 
 
 
245 aa  261  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  52.16 
 
 
257 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  51.06 
 
 
235 aa  260  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  51.5 
 
 
271 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  51.72 
 
 
256 aa  258  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  51.72 
 
 
290 aa  257  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  52.59 
 
 
260 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  52.16 
 
 
284 aa  255  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  51.5 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  52.14 
 
 
235 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  50.42 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  50 
 
 
235 aa  238  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.91 
 
 
234 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50.85 
 
 
235 aa  236  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  46.78 
 
 
277 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 
238 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.28 
 
 
235 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  53.42 
 
 
237 aa  234  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  47.44 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  47.01 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  47.21 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  49.36 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  46.06 
 
 
249 aa  233  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  51.29 
 
 
234 aa  231  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  49.58 
 
 
243 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.27 
 
 
236 aa  229  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.79 
 
 
233 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  47.28 
 
 
258 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  48.29 
 
 
236 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  47.64 
 
 
233 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  47.86 
 
 
234 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  48.71 
 
 
245 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  49.15 
 
 
236 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  49.79 
 
 
237 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 
233 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  48.36 
 
 
247 aa  228  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 
242 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 
247 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  50.21 
 
 
233 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  49.57 
 
 
242 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  46.91 
 
 
247 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.44 
 
 
235 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  49.58 
 
 
240 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  48.95 
 
 
237 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  48.56 
 
 
251 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  50 
 
 
249 aa  226  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 
247 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 
233 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  49.79 
 
 
238 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.36 
 
 
237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  46.78 
 
 
234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  45.92 
 
 
241 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  47.95 
 
 
247 aa  225  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.66 
 
 
234 aa  225  6e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  49.36 
 
 
234 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  46.67 
 
 
240 aa  224  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 
235 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.49 
 
 
236 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  47.72 
 
 
249 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  45.49 
 
 
236 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  47.86 
 
 
239 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  46.78 
 
 
233 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
259 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.58 
 
 
238 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  46.64 
 
 
238 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  47.01 
 
 
238 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  47.01 
 
 
238 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  46.25 
 
 
240 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  47.01 
 
 
238 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  46.84 
 
 
256 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  46.52 
 
 
236 aa  222  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 
234 aa  222  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  47.21 
 
 
233 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  48.29 
 
 
238 aa  222  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.64 
 
 
233 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
233 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  47.01 
 
 
238 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  49.15 
 
 
238 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  47.01 
 
 
238 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  47.01 
 
 
238 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  48.28 
 
 
235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  47.86 
 
 
236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  46.91 
 
 
247 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  45.34 
 
 
238 aa  221  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  47.86 
 
 
265 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  47.21 
 
 
233 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>