275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2086 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  100 
 
 
512 aa  1062    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  61.22 
 
 
577 aa  614  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  48.67 
 
 
603 aa  477  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  49.39 
 
 
603 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  48.67 
 
 
603 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  48.67 
 
 
603 aa  477  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  48.67 
 
 
603 aa  477  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  48.46 
 
 
603 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  48.25 
 
 
603 aa  471  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  48.25 
 
 
603 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  48.46 
 
 
603 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  47.94 
 
 
590 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  47.56 
 
 
598 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  44.58 
 
 
644 aa  437  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  44.51 
 
 
601 aa  426  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  45.21 
 
 
598 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  45.66 
 
 
588 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  42.54 
 
 
599 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  43.61 
 
 
596 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  44.76 
 
 
563 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  43 
 
 
564 aa  351  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  36.95 
 
 
558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  28.97 
 
 
604 aa  194  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 
598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  27.21 
 
 
600 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.54 
 
 
603 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  28.09 
 
 
597 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  29.59 
 
 
587 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  27.55 
 
 
591 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.38 
 
 
607 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  28.2 
 
 
625 aa  159  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  28.3 
 
 
897 aa  156  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0829  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  45.14 
 
 
188 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.46 
 
 
862 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.85 
 
 
568 aa  150  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 
888 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 
984 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  26.54 
 
 
670 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
803 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.25 
 
 
686 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  29.28 
 
 
1041 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  28.46 
 
 
1020 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  31.23 
 
 
1043 aa  134  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  32.01 
 
 
894 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  27.03 
 
 
1019 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.5 
 
 
858 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  26.54 
 
 
1084 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 
919 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.74 
 
 
743 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  26.11 
 
 
1024 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.37 
 
 
707 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.11 
 
 
903 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  26.61 
 
 
1028 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 
1084 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  26.98 
 
 
1129 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  27.56 
 
 
891 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  26.26 
 
 
1045 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  25.63 
 
 
1035 aa  123  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  23.94 
 
 
928 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.94 
 
 
1424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.07 
 
 
717 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  25.6 
 
 
1044 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  27.89 
 
 
1035 aa  120  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  28.01 
 
 
704 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.31 
 
 
1013 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 
1045 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.8 
 
 
805 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.72 
 
 
1041 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 
1077 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.01 
 
 
738 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  24.88 
 
 
1036 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.68 
 
 
837 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  24.89 
 
 
1032 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  25.32 
 
 
1029 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  29.45 
 
 
1076 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  29.15 
 
 
1017 aa  117  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.91 
 
 
1033 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.49 
 
 
986 aa  117  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.59 
 
 
811 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.39 
 
 
972 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  29.96 
 
 
1003 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  29.37 
 
 
1112 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.3 
 
 
787 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 
827 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  29.19 
 
 
961 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  29.23 
 
 
1024 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 
1017 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  24.79 
 
 
1036 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  26.52 
 
 
677 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  25.53 
 
 
1031 aa  113  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  25.88 
 
 
804 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.76 
 
 
922 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  25.28 
 
 
832 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 
806 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  27.74 
 
 
1059 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  25.89 
 
 
1024 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.89 
 
 
1024 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  25.89 
 
 
1024 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  25.89 
 
 
1024 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  25.89 
 
 
1024 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>