More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2772 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  95.36 
 
 		 381 aa  639    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 345 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  74.93 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  68.12 
 
 		 354 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  70.25 
 
 		 407 aa  471  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  71.06 
 
 		 378 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  65.88 
 
 		 353 aa  441  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  65.98 
 
 		 372 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  67.54 
 
 		 370 aa  430  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  61.58 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  59.65 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  57.94 
 
 		 350 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  60.18 
 
 		 346 aa  384  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  59.53 
 
 		 371 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  58.06 
 
 		 365 aa  374  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  56.56 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  57.35 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  59.08 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  57.06 
 
 		 345 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  57.27 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  55.03 
 
 		 354 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  57.61 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  55.59 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  52.48 
 
 		 345 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  55 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  55.62 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  56.16 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  52.19 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  53.45 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  53.45 
 
 		 372 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  53.45 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  52.24 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  52.3 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  52.65 
 
 		 361 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  51.72 
 
 		 354 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  51.72 
 
 		 354 aa  322  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 348 aa  315  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  49.22 
 
 		 340 aa  312  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 		 348 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  43.73 
 
 		 357 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  47.65 
 
 		 359 aa  305  9.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  41.23 
 
 		 345 aa  291  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  41.23 
 
 		 345 aa  291  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  50.31 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 344 aa  288  7e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  43.95 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  46.61 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  43.03 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  44.24 
 
 		 340 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  43.94 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  43.94 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  43.94 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  42.6 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  43.54 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  43.33 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  37.83 
 
 		 351 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  42.33 
 
 		 356 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  41.21 
 
 		 350 aa  238  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  42.12 
 
 		 357 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  38.37 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  41.72 
 
 		 402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  41.72 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  34.52 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.66 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  41.46 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  37.97 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  38.17 
 
 		 354 aa  229  7e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  40.54 
 
 		 353 aa  228  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  37.39 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  40.85 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  41.02 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  39.7 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  41.6 
 
 		 354 aa  222  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  39.7 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  39.7 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  39.7 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  39.7 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  39.7 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  41.09 
 
 		 355 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  39.7 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  39.7 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  39.7 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  39.78 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  39.5 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  40.72 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  40.72 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  38.11 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  40.72 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>