More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1675 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  83.71 
 
 		 226 aa  357  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  59.31 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  59.3 
 
 		 199 aa  214  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  52.05 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  52.53 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  53.43 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  54.77 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0681  riboflavin synthase, alpha subunit  53.14 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  54.46 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  55 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  52.86 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  53.73 
 
 		 203 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  53.73 
 
 		 203 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  53.73 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  53.96 
 
 		 202 aa  188  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  51.83 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  53.39 
 
 		 214 aa  187  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  52.45 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  56.31 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  51.94 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  51.71 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  52.22 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 205 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  49.34 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  51.61 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  52.48 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  50.72 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  47.09 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  52.24 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43.58 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  46.34 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  48.58 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  52.5 
 
 		 202 aa  164  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  49.02 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  48.5 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  46.29 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 200 aa  161  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  44.22 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  45 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  48.08 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  42.23 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  45.63 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  49 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  42.23 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  42.01 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  48.83 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  45.02 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.92 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  46.63 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  48.51 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  45.27 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.27 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.66 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  49.01 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  48.78 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 200 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 198 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  44.93 
 
 		 207 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  42.5 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>