72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0669 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0669  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 467 aa  952    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.774864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06050  tetratricopeptide repeat protein  35.42 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.807535  hitchhiker  0.00000000184751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1251  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 		 452 aa  246  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09190  tetratricopeptide repeat protein  34.2 
 
 		 455 aa  228  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.216592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 632 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.66 
 
 		 810 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 878 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 248 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 4079 aa  51.2  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.69 
 
 		 2240 aa  50.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 1061 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  26.7 
 
 		 676 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 602 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.31 
 
 		 725 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.5 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 922 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 1486 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 597 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 3145 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 2651 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.24 
 
 		 887 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.3 
 
 		 639 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.58 
 
 		 340 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  35.14 
 
 		 1004 aa  47.4  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 586 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 594 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 1737 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.27 
 
 		 576 aa  46.6  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 520 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 824 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  29.01 
 
 		 955 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 583 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 685 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  28.38 
 
 		 724 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 2262 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 705 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 2262 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.75 
 
 		 1013 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 739 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 1252 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 1252 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.82 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  24.14 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1069 aa  44.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1973  tetratricopeptide TPR_2  39.44 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 235 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 250 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.49 
 
 		 1694 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28.66 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09124  heat shock protein (Sti1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01860)  27.91 
 
 		 575 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1094 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 909 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  26.19 
 
 		 299 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1274 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  35.48 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 637 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 1121 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 629 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.11 
 
 		 2145 aa  43.5  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 543 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 393 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.21 
 
 		 714 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 732 aa  43.5  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  28.91 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 250 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  29.46 
 
 		 2679 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>