113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4016 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 323 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  60.56 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  59.48 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  58.82 
 
 		 322 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  30.1 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  25.23 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  29.1 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  29.1 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  30.58 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  28.41 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  28.17 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  24.71 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  26.36 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  23.32 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  22.33 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  21.94 
 
 		 663 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  28.96 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  26.01 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  25.08 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  27.46 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.31 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  31.53 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  25.33 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.84 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.76 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  28.1 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 675 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1468  transcriptional regulator-like protein  30.77 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125958  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.09 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  26.78 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.44 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.34 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  24.92 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.56 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.1 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  25 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  27.44 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  23.95 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.12 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  31.46 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  29.19 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  26.2 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  25.25 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  28.05 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  35.9 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  27.23 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  25.34 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  24.18 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  24.18 
 
 		 325 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  24.18 
 
 		 325 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.5 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.26 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  27.52 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  27.67 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  23.73 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  23.53 
 
 		 663 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.87 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.05 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.94 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  28.49 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.81 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.64 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  26.64 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.16 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.62 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  25.48 
 
 		 687 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  22.99 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  21.4 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  27.07 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.6 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  27.15 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.65 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  39.34 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  29.12 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  29.01 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  21.51 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2673  hypothetical protein  40 
 
 		 698 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.749079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2054  transcriptional regulator protein-like protein  39.29 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0485994  normal  0.848173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  28.87 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.07 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  24.49 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  17.11 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 683 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  25.4 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  22.78 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  25.85 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.9 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2168  transcriptional regulator-like protein  28.57 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  hitchhiker  0.000000957386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  25.1 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  27.54 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  28.81 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  33.73 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  29.08 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>