More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5715 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5715  Transketolase central region  100 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1273  transketolase central region  62.71 
 
 		 303 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.257757  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4002  Transketolase central region  59.93 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226763  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6362  Transketolase central region  55.18 
 
 		 307 aa  291  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4473  transketolase, central region  58.22 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0113424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4986  transketolase central region  58.22 
 
 		 296 aa  269  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.545662  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  26.47 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  31.3 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  30.64 
 
 		 592 aa  95.1  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  29.11 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  36.97 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  28.09 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  28.09 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  30.64 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  24.91 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  30.8 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0983  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  32.95 
 
 		 624 aa  89.7  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  29.28 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  28.73 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  28.39 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  29.43 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  33.33 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2875  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.11 
 
 		 632 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1747  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.94 
 
 		 635 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  32.97 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1501  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.26 
 
 		 636 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  30.63 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3373  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  32.63 
 
 		 639 aa  85.9  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2615  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.25 
 
 		 637 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207867  normal  0.922526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  32.47 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  26.79 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  29.58 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  26.14 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  28.95 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  27.73 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  29.75 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  28.03 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2015  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.77 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0928222  hitchhiker  0.00382162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2033  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.22 
 
 		 636 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.720268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.66 
 
 		 625 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1069  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.64 
 
 		 643 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  33.9 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1764  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.29 
 
 		 626 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0479282  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  30.34 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1430  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.4 
 
 		 643 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0956  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.99 
 
 		 629 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.922207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2426  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.65 
 
 		 636 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  29.48 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5103  Transketolase central region  31.16 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.47717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1852  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  27.1 
 
 		 640 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1398  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  27.94 
 
 		 629 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0943  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.32 
 
 		 635 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  25.27 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1048  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.38 
 
 		 622 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  32.45 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2221  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.62 
 
 		 636 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  29.1 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09721  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.83 
 
 		 628 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.274515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0484  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.57 
 
 		 636 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0190528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  32.73 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  29.67 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  29.26 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  33.33 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  27.51 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2211  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.14 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0180  transketolase, central region  29.8 
 
 		 162 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0300  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.83 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.533137  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  29.12 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0471  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.2 
 
 		 636 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2073  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  24.32 
 
 		 619 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  32.47 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1662  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  29.33 
 
 		 626 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.184143  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  28.02 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0406  Transketolase central region  30.45 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0236  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32 
 
 		 614 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.947213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1787  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  24.32 
 
 		 619 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3488  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.03 
 
 		 631 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0451312  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4820  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.96 
 
 		 646 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3648  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.14 
 
 		 634 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6781  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.46 
 
 		 653 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772471  hitchhiker  0.0000939262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4486  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.14 
 
 		 646 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  34.34 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3879  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.14 
 
 		 646 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1718  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.61 
 
 		 641 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0789997  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1571  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.95 
 
 		 632 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  28.46 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3948  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.77 
 
 		 632 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1058  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.77 
 
 		 608 aa  75.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00967368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  27.42 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2827  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.31 
 
 		 635 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3250  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.14 
 
 		 646 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0235548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2448  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  29.41 
 
 		 631 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  30.96 
 
 		 636 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  28.69 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3776  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.14 
 
 		 634 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495759  normal  0.0534173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3347  Transketolase central region  30.74 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.027962  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0905  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.28 
 
 		 617 aa  75.5  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2403  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.36 
 
 		 626 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1758  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.37 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.805776 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1694  1-Deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.84 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.134316  normal  0.0277937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>