177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3492 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 157 aa  300  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 175 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  43.57 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  43.57 
 
 		 157 aa  93.6  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 		 230 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 253 aa  87.8  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  49.48 
 
 		 218 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  42.76 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 282 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  43.62 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  37.24 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  32.56 
 
 		 255 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  34.4 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  39.73 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  39.73 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  36 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  47.69 
 
 		 334 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  47.69 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  47.69 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  47.69 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  47.69 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  47.69 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 229 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  54.55 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  47.69 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  55.77 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  45.1 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 229 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  54.55 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  54.55 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  50.91 
 
 		 347 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  29.77 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  29.46 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  36 
 
 		 524 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  38.36 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40.51 
 
 		 314 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  37.5 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  50.91 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  51.16 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  31.34 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  48.39 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  41.18 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  42.65 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  30.61 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  30.61 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  53.66 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.37 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  41.18 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  31.34 
 
 		 164 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  31.34 
 
 		 153 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  51.06 
 
 		 137 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>