More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0851 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  49.89 
 
 		 1106 aa  659    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  49.56 
 
 		 1119 aa  748    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  66 
 
 		 1090 aa  988    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  51.28 
 
 		 1091 aa  721    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  50.29 
 
 		 1091 aa  694    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  48.1 
 
 		 1162 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  47.05 
 
 		 1144 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  50.06 
 
 		 1091 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1349 aa  2586    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  52.41 
 
 		 1111 aa  749    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  50.06 
 
 		 1091 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  50.82 
 
 		 1086 aa  668    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  50.65 
 
 		 1101 aa  701    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  45.82 
 
 		 1108 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  47.34 
 
 		 1120 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  43.76 
 
 		 1150 aa  569  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  44.33 
 
 		 1128 aa  563  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.28 
 
 		 1228 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  43.34 
 
 		 1041 aa  537  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  41.71 
 
 		 1164 aa  538  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  42.13 
 
 		 1128 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  44.36 
 
 		 1162 aa  523  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.59 
 
 		 1111 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  40.44 
 
 		 1103 aa  506  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  44.38 
 
 		 1192 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  46.54 
 
 		 1128 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  40.89 
 
 		 1124 aa  485  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  42.37 
 
 		 1130 aa  466  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  43.66 
 
 		 1088 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  39.05 
 
 		 1073 aa  430  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  37.54 
 
 		 1183 aa  426  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.88 
 
 		 1119 aa  422  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.56 
 
 		 1094 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  38.08 
 
 		 1167 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  39.43 
 
 		 1136 aa  412  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.74 
 
 		 1176 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  28.89 
 
 		 1343 aa  226  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 		 1397 aa  185  6e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.59 
 
 		 786 aa  172  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.7 
 
 		 858 aa  171  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.6 
 
 		 729 aa  167  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.63 
 
 		 851 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.43 
 
 		 849 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.52 
 
 		 765 aa  167  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 		 680 aa  165  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  28.35 
 
 		 659 aa  165  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 1019 aa  165  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.75 
 
 		 773 aa  162  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.39 
 
 		 838 aa  158  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.18 
 
 		 785 aa  158  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.8 
 
 		 763 aa  158  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  21.94 
 
 		 1016 aa  157  9e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  26.32 
 
 		 762 aa  156  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.22 
 
 		 732 aa  155  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.65 
 
 		 795 aa  155  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.55 
 
 		 737 aa  155  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  24.62 
 
 		 900 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.15 
 
 		 754 aa  154  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.08 
 
 		 730 aa  153  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.08 
 
 		 730 aa  153  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 		 707 aa  153  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.75 
 
 		 729 aa  153  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 739 aa  153  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  23.82 
 
 		 765 aa  152  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 736 aa  152  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.25 
 
 		 830 aa  152  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  25.06 
 
 		 789 aa  152  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.26 
 
 		 794 aa  151  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.35 
 
 		 857 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.29 
 
 		 896 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 743 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  21.68 
 
 		 638 aa  150  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.69 
 
 		 828 aa  150  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 768 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.75 
 
 		 831 aa  150  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  28.67 
 
 		 669 aa  149  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.49 
 
 		 715 aa  149  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.75 
 
 		 705 aa  149  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  26.39 
 
 		 735 aa  149  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.33 
 
 		 706 aa  149  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.95 
 
 		 1023 aa  148  7.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.11 
 
 		 864 aa  148  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  24.6 
 
 		 678 aa  147  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  23.09 
 
 		 773 aa  147  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.51 
 
 		 768 aa  147  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.93 
 
 		 756 aa  147  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.39 
 
 		 892 aa  147  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  26.83 
 
 		 771 aa  147  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  25.41 
 
 		 669 aa  146  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.26 
 
 		 669 aa  146  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.03 
 
 		 858 aa  145  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.04 
 
 		 672 aa  145  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  25.97 
 
 		 848 aa  145  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.41 
 
 		 783 aa  145  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  27.41 
 
 		 786 aa  145  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.83 
 
 		 694 aa  145  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.31 
 
 		 817 aa  144  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.18 
 
 		 781 aa  144  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.33 
 
 		 730 aa  144  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 799 aa  143  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>