61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2530 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  100 
 
 		 928 aa  1922    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  66.31 
 
 		 928 aa  1268    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  61.05 
 
 		 622 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  70.38 
 
 		 926 aa  1347    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  59.89 
 
 		 909 aa  1102    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  65.22 
 
 		 918 aa  1226    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  74.62 
 
 		 926 aa  1433    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  65.71 
 
 		 932 aa  1239    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  63.85 
 
 		 921 aa  1202    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  54.15 
 
 		 929 aa  981    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  37.18 
 
 		 912 aa  629  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  38.5 
 
 		 914 aa  618  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  36.71 
 
 		 916 aa  591  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  38.02 
 
 		 871 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  34.75 
 
 		 933 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  33.86 
 
 		 908 aa  487  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  34.95 
 
 		 937 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  33.64 
 
 		 909 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  34.38 
 
 		 919 aa  436  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  32.75 
 
 		 928 aa  432  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  33.46 
 
 		 929 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  30.73 
 
 		 934 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  33.29 
 
 		 934 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  32.59 
 
 		 955 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  32.05 
 
 		 941 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  26.71 
 
 		 978 aa  174  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1151 aa  153  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1173 aa  135  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1184 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  23.83 
 
 		 925 aa  115  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  25.68 
 
 		 918 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  27.32 
 
 		 621 aa  109  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0349  hypothetical protein  63.16 
 
 		 115 aa  109  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  24.71 
 
 		 973 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1188 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1018 aa  97.8  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1154 aa  93.6  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1170 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  23.9 
 
 		 1186 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1363 aa  72.8  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  24.28 
 
 		 869 aa  71.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  34.48 
 
 		 97 aa  67.4  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1282 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1347 aa  60.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.27 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  22.09 
 
 		 536 aa  55.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1353 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.4 
 
 		 995 aa  52.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1342 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  30.18 
 
 		 1041 aa  52  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1243 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1346 aa  51.6  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1298 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1339 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1290 aa  48.5  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  41.79 
 
 		 1180 aa  45.8  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  27.36 
 
 		 504 aa  46.2  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1365 aa  45.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1036 aa  45.8  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  35.23 
 
 		 1205 aa  44.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1452 aa  44.7  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>