292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3880 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3880  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  266  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0869026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4023  SEC-C motif domain protein  95.83 
 
 		 133 aa  231  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3986  SEC-C motif domain protein  45.76 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4025  SecC motif-containing protein  43.81 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  68.57 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  68.57 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  68.57 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  82.76 
 
 		 328 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  57.89 
 
 		 958 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  80.77 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  81.82 
 
 		 420 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  53.33 
 
 		 225 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  71.43 
 
 		 294 aa  50.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  61.29 
 
 		 893 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  46.15 
 
 		 1022 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  72 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  48.78 
 
 		 902 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00180  methionine aminopeptidase, type I  76 
 
 		 290 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.55421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  78.26 
 
 		 288 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  33.33 
 
 		 260 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  72 
 
 		 864 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  64 
 
 		 314 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  52 
 
 		 910 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  62.07 
 
 		 918 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 899 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  58.82 
 
 		 993 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  56.67 
 
 		 844 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  55.88 
 
 		 848 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  42.59 
 
 		 936 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  68 
 
 		 274 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  37.68 
 
 		 309 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 919 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  79.17 
 
 		 278 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  48.72 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  51.16 
 
 		 962 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 1113 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 915 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  55 
 
 		 438 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  45.28 
 
 		 923 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1538  SEC-C motif domain protein  47.37 
 
 		 822 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  53.85 
 
 		 962 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  32.17 
 
 		 914 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  75 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  39.74 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  51.16 
 
 		 962 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  51.52 
 
 		 845 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  37.29 
 
 		 907 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 907 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  41.07 
 
 		 291 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3439  methionine aminopeptidase, type I  62.07 
 
 		 289 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0407215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  38.6 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  41.07 
 
 		 916 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 908 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 844 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 837 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 909 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 907 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  54.55 
 
 		 235 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  59.46 
 
 		 259 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 908 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  42.86 
 
 		 925 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 276 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 907 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  62.96 
 
 		 289 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  62.96 
 
 		 289 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  58.33 
 
 		 375 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 908 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 908 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 908 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 908 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  46.94 
 
 		 922 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 908 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 911 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 276 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  72 
 
 		 284 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 944 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  52.5 
 
 		 920 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 917 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  70.83 
 
 		 325 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  80 
 
 		 377 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  37.5 
 
 		 1004 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 888 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  54.29 
 
 		 1024 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 272 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  58.06 
 
 		 930 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 904 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 1029 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  70.37 
 
 		 432 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 1027 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 904 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  58.06 
 
 		 907 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 904 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 1067 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 917 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 858 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  48.65 
 
 		 593 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 837 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 1118 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  55.17 
 
 		 535 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  41.94 
 
 		 1024 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>