More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3714 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 117 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  47.41 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 122 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 123 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 124 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.96 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 131 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.9 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  42.11 
 
 		 122 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  46.15 
 
 		 202 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 137 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  46.6 
 
 		 128 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 122 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  41.74 
 
 		 212 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 213 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.61 
 
 		 210 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0583  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 123 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 122 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 209 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 123 aa  99.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 214 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 128 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 133 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  45.76 
 
 		 211 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 203 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1518  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 143 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.61 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  42.74 
 
 		 210 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 129 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 132 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.24 
 
 		 215 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 124 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5521  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 120 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 208 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 136 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  39.64 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2318  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 125 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 127 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  41.6 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 203 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6855  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 124 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 207 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 		 212 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0844  response regulator receiver protein  46.73 
 
 		 130 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 213 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6901  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 123 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279255  normal  0.546779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  40.18 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.28 
 
 		 211 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.28 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  40.18 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 220 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 208 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 210 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  40.35 
 
 		 214 aa  92  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 218 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  37.82 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2885  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 123 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0232  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 124 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156918  normal  0.401209 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  39.37 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  39.37 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>