242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3211 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  100 
 
 		 680 aa  1396    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  40.96 
 
 		 686 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  36.6 
 
 		 672 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  34.2 
 
 		 694 aa  332  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  33.28 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  33.6 
 
 		 702 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  32.28 
 
 		 666 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  27.89 
 
 		 490 aa  143  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  27.99 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  27.37 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.42 
 
 		 1005 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  27.42 
 
 		 819 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.71 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.9 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  25.82 
 
 		 484 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  27.97 
 
 		 1014 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  26.5 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.43 
 
 		 440 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  26.3 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  26.33 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  28.31 
 
 		 435 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  25.22 
 
 		 451 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  23.97 
 
 		 512 aa  98.2  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  24.82 
 
 		 1010 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  24.71 
 
 		 455 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  25.25 
 
 		 438 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  24.79 
 
 		 438 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  24.84 
 
 		 543 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.56 
 
 		 1059 aa  94.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  24.09 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.27 
 
 		 1040 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  25.22 
 
 		 441 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.27 
 
 		 1042 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1042 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  24.18 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.26 
 
 		 1066 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.19 
 
 		 1069 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  23.33 
 
 		 1081 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  24.78 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  25.82 
 
 		 431 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.36 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  25.69 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.17 
 
 		 1071 aa  82  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  24.48 
 
 		 1084 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  23.63 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.17 
 
 		 407 aa  80.5  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.18 
 
 		 426 aa  80.1  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  22.78 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  23.01 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  25.16 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  22.13 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  23.49 
 
 		 437 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.08 
 
 		 444 aa  77  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  24.94 
 
 		 391 aa  76.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  23.61 
 
 		 1067 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  24.84 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  22.75 
 
 		 1060 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  24.84 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  24.84 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  24.15 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  22.8 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  24.29 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  24.49 
 
 		 434 aa  73.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  24.76 
 
 		 1065 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  23.68 
 
 		 585 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  24.54 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  23.36 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  26.1 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  23.93 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  25.33 
 
 		 419 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  25.33 
 
 		 419 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  22.95 
 
 		 433 aa  72  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  22.98 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  23.55 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  23.59 
 
 		 1031 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  23.17 
 
 		 1062 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  23.13 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  22.91 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  23.58 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  21.48 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  22.54 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  24.14 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  22.92 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  24.04 
 
 		 1138 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.54 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  23.63 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  23.31 
 
 		 1111 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  24.13 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  22.98 
 
 		 1062 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  23.16 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  22.57 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  22.37 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  22.57 
 
 		 1062 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  22.57 
 
 		 1062 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  22.57 
 
 		 1062 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  26.09 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  23.32 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  24.29 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  24.29 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  24.29 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>