More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1160 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  44.4 
 
 
272 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 
262 aa  225  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 
280 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  44.78 
 
 
280 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  46.12 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  44.18 
 
 
255 aa  217  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  47.58 
 
 
264 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  44.18 
 
 
255 aa  215  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  45.16 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  43.37 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 
266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  43.78 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 
265 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  47.83 
 
 
263 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  47.73 
 
 
265 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  42.17 
 
 
256 aa  209  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  40.95 
 
 
279 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  45.49 
 
 
267 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  44.67 
 
 
267 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  45.89 
 
 
266 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  43.64 
 
 
271 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  46.96 
 
 
267 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  45.04 
 
 
268 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 
266 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  45.2 
 
 
271 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 
265 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  41.09 
 
 
274 aa  205  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  44.31 
 
 
263 aa  205  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  46.88 
 
 
269 aa  205  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 
271 aa  205  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  45.65 
 
 
278 aa  204  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  43.78 
 
 
267 aa  204  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  45.12 
 
 
268 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  43.82 
 
 
267 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  43.82 
 
 
267 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  51.6 
 
 
306 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  50.86 
 
 
273 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  44.91 
 
 
271 aa  202  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1308  tryptophan synthase subunit alpha  43.86 
 
 
267 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  41.34 
 
 
266 aa  201  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1255  tryptophan synthase subunit alpha  43.86 
 
 
267 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00504507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  44.59 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  40.55 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  48.16 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  35.2 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  43.64 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  43.6 
 
 
269 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  48.05 
 
 
272 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  41.87 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  45.45 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  45.58 
 
 
302 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  44.14 
 
 
265 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  50.24 
 
 
267 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  45.15 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  44.64 
 
 
262 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  44.64 
 
 
262 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  44.64 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  44.22 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  43.16 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  40.7 
 
 
259 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  46 
 
 
274 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  40.84 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  42.08 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  41.67 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  44.4 
 
 
268 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  43.6 
 
 
285 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  45.78 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  44.83 
 
 
261 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 
269 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  40.46 
 
 
279 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  43.61 
 
 
260 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 
273 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  41.94 
 
 
265 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  34.94 
 
 
257 aa  193  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  44.62 
 
 
276 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  42.35 
 
 
268 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  44.19 
 
 
285 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 
269 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  46.43 
 
 
262 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  43.43 
 
 
285 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  44 
 
 
265 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  41.53 
 
 
265 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.96 
 
 
279 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  43.36 
 
 
270 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  42.58 
 
 
266 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  42.61 
 
 
279 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  36 
 
 
256 aa  191  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  45.33 
 
 
264 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  42.23 
 
 
274 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  39.92 
 
 
268 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  44.84 
 
 
275 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  39.69 
 
 
270 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 
253 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 
279 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  43.91 
 
 
268 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  45.06 
 
 
277 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>