More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0272 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  100 
 
 		 232 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2015  GntR family transcriptional regulator  79.91 
 
 		 235 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  54.26 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  56.81 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  50.45 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.48 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.48 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.05 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  35.14 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.8 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.09 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.48 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.65 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  33.03 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  32.3 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.73 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  31.8 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  31.58 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  31.58 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  31.58 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  32.66 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 252 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 258 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  36.07 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  34.33 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  33.96 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.38 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  33.48 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.48 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  31.58 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1647  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 289 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  31.56 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  30.21 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  33.5 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  35.78 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.63 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.89 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 337 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  30.7 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  30.7 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  30.7 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  30.7 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.09 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.13 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.89 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  28.24 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.78 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  33.49 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  32.71 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.16 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  34.27 
 
 		 252 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.91 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  37.21 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  30.18 
 
 		 247 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  30.18 
 
 		 247 aa  91.7  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  30.18 
 
 		 247 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  32.55 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  30.59 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  34.86 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>