294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1237 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.48 
 
 
252 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  58.43 
 
 
185 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  56.52 
 
 
241 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.24 
 
 
220 aa  202  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  56.04 
 
 
191 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.33 
 
 
261 aa  201  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.34 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  58.66 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  57.74 
 
 
282 aa  197  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  58.29 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.94 
 
 
205 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  55.81 
 
 
252 aa  191  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  55.81 
 
 
193 aa  188  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.8 
 
 
320 aa  188  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.14 
 
 
224 aa  187  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  61.76 
 
 
253 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  55.8 
 
 
241 aa  185  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 
229 aa  184  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.8 
 
 
279 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.15 
 
 
221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  52.54 
 
 
231 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.35 
 
 
193 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.46 
 
 
224 aa  180  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  52.57 
 
 
243 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  53.14 
 
 
231 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  53.14 
 
 
231 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  49.21 
 
 
231 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.37 
 
 
254 aa  177  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.78 
 
 
269 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  56.21 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.46 
 
 
208 aa  164  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  52.25 
 
 
191 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.7 
 
 
225 aa  161  5.0000000000000005e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  44.44 
 
 
243 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.19 
 
 
237 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  53.75 
 
 
229 aa  155  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  46.55 
 
 
238 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  47.9 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  46.2 
 
 
181 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  37.99 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 
187 aa  128  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  43.21 
 
 
387 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  38.1 
 
 
282 aa  126  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.69 
 
 
387 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  37.69 
 
 
372 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.03 
 
 
193 aa  124  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.73 
 
 
189 aa  124  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  32.58 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.17 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.61 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.72 
 
 
534 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  40.12 
 
 
352 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  34.59 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  34.97 
 
 
183 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.07 
 
 
273 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  42.86 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  37.89 
 
 
190 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  37.89 
 
 
190 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  37.89 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  37.89 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  37.89 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  37.89 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.77 
 
 
195 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  37.89 
 
 
190 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  37.89 
 
 
190 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 
185 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.82 
 
 
237 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  39.78 
 
 
195 aa  111  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  35.44 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.38 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.51 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  37.27 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.4 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  44.53 
 
 
353 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  38.5 
 
 
201 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.41 
 
 
211 aa  108  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.89 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 
206 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 
190 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  36.88 
 
 
193 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  34.25 
 
 
194 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.67 
 
 
200 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  34.73 
 
 
179 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  38.3 
 
 
274 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  45.95 
 
 
187 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  37.8 
 
 
206 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  35.88 
 
 
183 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  32.76 
 
 
195 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  32.18 
 
 
195 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  35.79 
 
 
193 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  38.61 
 
 
221 aa  104  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  36.87 
 
 
193 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  39.39 
 
 
178 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  46.67 
 
 
394 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 
186 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>