83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1066 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  100 
 
 
744 aa  1523    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  26.89 
 
 
1096 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  26.65 
 
 
1219 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  30.94 
 
 
1332 aa  120  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  31.54 
 
 
499 aa  108  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  28.62 
 
 
1047 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  28.66 
 
 
675 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  30.05 
 
 
1141 aa  92  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.91 
 
 
587 aa  91.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  33.52 
 
 
606 aa  88.6  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  28.48 
 
 
482 aa  88.2  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.62 
 
 
3586 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  30.59 
 
 
827 aa  84  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.49 
 
 
587 aa  82  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  28.57 
 
 
5561 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  28.23 
 
 
5561 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  29.04 
 
 
5559 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 
626 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  29.04 
 
 
5559 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  28.15 
 
 
5561 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.12 
 
 
612 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.02 
 
 
626 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  30.98 
 
 
606 aa  74.3  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  25.08 
 
 
1224 aa  73.9  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.33 
 
 
5743 aa  70.5  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 
1143 aa  69.7  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  26.6 
 
 
2656 aa  68.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  36.94 
 
 
491 aa  62.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  21.75 
 
 
3325 aa  62.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  23.53 
 
 
1146 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.5 
 
 
2350 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  25.11 
 
 
1695 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  24.48 
 
 
3824 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  21.96 
 
 
1124 aa  59.7  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  23.61 
 
 
1152 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  24.37 
 
 
1424 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  24.48 
 
 
3721 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  24.24 
 
 
3824 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  28.76 
 
 
2552 aa  59.7  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  24.24 
 
 
3824 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.88 
 
 
1919 aa  57.4  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  24.01 
 
 
3739 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  23.4 
 
 
1428 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  28.63 
 
 
3227 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  23.98 
 
 
1406 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  30.97 
 
 
820 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.41 
 
 
12684 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.19 
 
 
1505 aa  54.7  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.56 
 
 
3552 aa  54.3  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  21.93 
 
 
1452 aa  53.9  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  31.52 
 
 
663 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  28.02 
 
 
892 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.89 
 
 
5216 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  25.2 
 
 
1278 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  31.19 
 
 
343 aa  52.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
1127 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  25.91 
 
 
1570 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  26.12 
 
 
1457 aa  51.2  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  30.14 
 
 
1792 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  28.5 
 
 
653 aa  51.2  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  21.87 
 
 
846 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  25.58 
 
 
1570 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  22.57 
 
 
4106 aa  50.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  24.8 
 
 
846 aa  49.7  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  23.14 
 
 
1031 aa  48.9  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  26.32 
 
 
1902 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  26.11 
 
 
1127 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  25.99 
 
 
805 aa  48.1  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  28.85 
 
 
1581 aa  47.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  25.23 
 
 
2704 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  24.46 
 
 
1123 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
1127 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  24.17 
 
 
739 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  24.48 
 
 
2886 aa  45.8  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.02 
 
 
692 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  26.62 
 
 
1127 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  32.58 
 
 
1275 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  23.38 
 
 
1951 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  25.25 
 
 
2528 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  23.94 
 
 
3925 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  28.39 
 
 
14944 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6407  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.03 
 
 
718 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  30.63 
 
 
689 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>