12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6407 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6407  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  100 
 
 		 718 aa  1439    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3565  hypothetical protein  25.24 
 
 		 791 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0023  putative YD repeat protein  23.95 
 
 		 683 aa  131  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3549  hypothetical protein  21.9 
 
 		 748 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2623  hypothetical protein  29.55 
 
 		 648 aa  55.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.722578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 651 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3603  hypothetical protein  33.04 
 
 		 640 aa  47.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  29.6 
 
 		 464 aa  47.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  34 
 
 		 608 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3389  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  46.2  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  34.43 
 
 		 1024 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  28.03 
 
 		 744 aa  44.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>