More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0978 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  100 
 
 
689 aa  1414    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  43.16 
 
 
656 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  39.26 
 
 
641 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  38.37 
 
 
569 aa  228  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  38.37 
 
 
565 aa  217  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  37.97 
 
 
574 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  38.49 
 
 
562 aa  197  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  36.75 
 
 
567 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  32.79 
 
 
321 aa  93.2  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  34.46 
 
 
327 aa  87  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  26.72 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  26.72 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  30.95 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  39.62 
 
 
582 aa  80.5  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  41.6 
 
 
352 aa  79  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  37.6 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  35.77 
 
 
590 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  35.29 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  36.61 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  33.99 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  36.88 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  36.16 
 
 
482 aa  75.1  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.06 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  36.6 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  36.43 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  37.1 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38.89 
 
 
301 aa  73.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  37.78 
 
 
754 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  37.9 
 
 
421 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  37.9 
 
 
421 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  37.9 
 
 
400 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  39.34 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  35.07 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.9 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  34.9 
 
 
323 aa  73.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  35.26 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  39.33 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  35.95 
 
 
603 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  34.68 
 
 
468 aa  72  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  35.95 
 
 
603 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  41.8 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  32.54 
 
 
824 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.06 
 
 
343 aa  72  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  38.4 
 
 
293 aa  72  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  36.29 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  32.37 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  34.21 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  37.1 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  33.76 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  40.34 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  34.16 
 
 
302 aa  70.5  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  40.87 
 
 
262 aa  70.5  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  33.33 
 
 
448 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  36.8 
 
 
375 aa  70.1  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  33.94 
 
 
402 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  33.73 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  33.73 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  34.51 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  35.97 
 
 
302 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  31.21 
 
 
788 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  36.15 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  37.9 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  34.34 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  38.94 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  33.73 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  33.58 
 
 
751 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  36.64 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  30.5 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  36.44 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  36.8 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  32.8 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  34.81 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  34.38 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  36.8 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  36.8 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.11 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  36.15 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  28.32 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.11 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  40.71 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0013  Peptidase M23  25.93 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.958477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  33.12 
 
 
386 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  36.57 
 
 
308 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.12 
 
 
386 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  30.95 
 
 
454 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  29.14 
 
 
323 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  32.8 
 
 
345 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  33.12 
 
 
386 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  33.12 
 
 
386 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  34.88 
 
 
446 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  40.6 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  32.75 
 
 
443 aa  66.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  39.66 
 
 
334 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  35.25 
 
 
430 aa  66.6  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  34.4 
 
 
229 aa  66.6  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.12 
 
 
386 aa  65.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  33.85 
 
 
324 aa  65.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  36.28 
 
 
454 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  33.6 
 
 
512 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  33.07 
 
 
414 aa  65.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>