87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0997 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  100 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  85.86 
 
 
203 aa  315  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  84.82 
 
 
203 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  69.35 
 
 
203 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  70.41 
 
 
207 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2920  fimbrial assembly  65.15 
 
 
211 aa  264  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  65.43 
 
 
206 aa  236  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  64.86 
 
 
227 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0673  fimbrial assembly family protein  58.02 
 
 
163 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  56.22 
 
 
212 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3112  fimbrial assembly protein  57.3 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.230305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  41.71 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  43.26 
 
 
213 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  39.89 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  39.3 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2905  Fimbrial assembly family protein  41.71 
 
 
210 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  40.99 
 
 
221 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  40.99 
 
 
220 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  41.71 
 
 
210 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  40.49 
 
 
290 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  38.2 
 
 
194 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  37.75 
 
 
201 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  37.06 
 
 
194 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  35.71 
 
 
194 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  37.06 
 
 
194 aa  121  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  35.71 
 
 
194 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  36.73 
 
 
194 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  35.71 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  35.71 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  37.37 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  35.9 
 
 
193 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  43.29 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  35.36 
 
 
193 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  33.33 
 
 
197 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  34.36 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  35.71 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  37.89 
 
 
190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  36.67 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  39.75 
 
 
198 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  39.75 
 
 
198 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  36.67 
 
 
191 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  33.51 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  35.71 
 
 
187 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  39.74 
 
 
167 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  39.1 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  32.8 
 
 
194 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  37.74 
 
 
182 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  36.59 
 
 
196 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  37.74 
 
 
182 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
187 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  35.9 
 
 
197 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  35.9 
 
 
197 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  37.65 
 
 
187 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  39.13 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  36.11 
 
 
191 aa  97.1  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  37.16 
 
 
219 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  32.68 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  30.1 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  28.64 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  29.56 
 
 
193 aa  92  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  33.33 
 
 
188 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  29.09 
 
 
221 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  30.73 
 
 
196 aa  88.2  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0159  fimbrial assembly family protein  28.65 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.519903  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  30.65 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  30.86 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  31.68 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  28.11 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  30.48 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  29.66 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  29.56 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  28.05 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  26.42 
 
 
192 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00032  fimbrial assembly protein PilN  31.51 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  23.04 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  21.29 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2202  Fimbrial assembly family protein  31.06 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  28.67 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  22.89 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  25.64 
 
 
166 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  25.69 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  26.85 
 
 
178 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0334  Fimbrial assembly family protein  27.27 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5132  fimbrial assembly family protein  28.47 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  22.28 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1176  Fimbrial assembly family protein  26.67 
 
 
462 aa  42.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1515  fimbrial assembly family protein  24.66 
 
 
177 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>