More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14541 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  100 
 
 		 288 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  53.82 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  48.71 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  48.87 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  46.42 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  47.19 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  45.56 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  45.69 
 
 		 273 aa  251  7e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  47.92 
 
 		 271 aa  251  9.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  47.74 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  46.24 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  46.21 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  45.9 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  45.11 
 
 		 279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  45.28 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  46.15 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.78 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  44.74 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  44.53 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  42.54 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  45.49 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  42.31 
 
 		 263 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  44.96 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  43.23 
 
 		 277 aa  234  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  41.73 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  43.7 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  41.73 
 
 		 274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.18 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  44.53 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  44.15 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  40.96 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  43.07 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  43.68 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  43.07 
 
 		 275 aa  221  8e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  40.88 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  40.23 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  42.7 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  43.02 
 
 		 281 aa  219  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  38.95 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  41.73 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  39.56 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  41.01 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  41.42 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  42.26 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  40.07 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  40.43 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  39.93 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  41.89 
 
 		 269 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  40.82 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  43.28 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  37.31 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  39.25 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  38.87 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  38.85 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  36.98 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  36.78 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  40.28 
 
 		 689 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  40.44 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  41.35 
 
 		 606 aa  195  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  39.77 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.85 
 
 		 555 aa  193  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  36.04 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  36.15 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  37.31 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  41.04 
 
 		 618 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  40.98 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  35.67 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5105  Transketolase domain protein  41.29 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  36.8 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  37.5 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  40.98 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  40.98 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  37.5 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  38.43 
 
 		 631 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  40.42 
 
 		 280 aa  185  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  36.19 
 
 		 267 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  37.08 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2514  transketolase subunit A  40.62 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  34.74 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  35.29 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  36.04 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  37.41 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  38.18 
 
 		 640 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  38.29 
 
 		 621 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  38.06 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  36.2 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  39.33 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  36.86 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  34.93 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  37.45 
 
 		 285 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  36.86 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0341  Transketolase domain protein  36.98 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  35.29 
 
 		 624 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  36.43 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  35.27 
 
 		 277 aa  175  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  34.78 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  34.2 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  36.47 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  35.9 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>