79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2878 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2878  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 235 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 77 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 		 187 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 124 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1604  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 516 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 106 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  29.14 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  35.14 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 199 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 195 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  41.07 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.43 
 
 		 376 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  34.02 
 
 		 123 aa  45.1  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  52.08 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8486  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  42.11 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6642  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  32.43 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0597755  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 101 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  32.31 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 161 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 105 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  39.58 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 67 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.51 
 
 		 377 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 528 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 333 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 108 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 333 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 100 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3773  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.33 
 
 		 294 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 259 aa  42  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 80 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 505 aa  42  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2064  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  34.21 
 
 		 299 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  42.22 
 
 		 94 aa  42  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 117 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 182 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 186 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 183 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 183 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  26.25 
 
 		 200 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 189 aa  41.6  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 198 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 198 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>