More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2844 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  100 
 
 
259 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  55.06 
 
 
256 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  57.53 
 
 
251 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  51.11 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  57.03 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  45.91 
 
 
257 aa  178  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  64.49 
 
 
278 aa  152  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  52.63 
 
 
297 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  43.82 
 
 
264 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  53.1 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.72 
 
 
313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  53.04 
 
 
216 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.71 
 
 
391 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  54.44 
 
 
246 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  37.65 
 
 
368 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  38.34 
 
 
367 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
257 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.07 
 
 
556 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  47.87 
 
 
265 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  47.27 
 
 
368 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  48.67 
 
 
240 aa  103  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
524 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  42.54 
 
 
333 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  53.47 
 
 
370 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.52 
 
 
332 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
535 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  34.9 
 
 
246 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  38.37 
 
 
200 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
392 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  44.09 
 
 
217 aa  98.6  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  52.13 
 
 
317 aa  98.6  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.43 
 
 
176 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  50 
 
 
197 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
476 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  50.55 
 
 
232 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  49.53 
 
 
432 aa  95.5  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.99 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  55.81 
 
 
335 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
340 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  49.54 
 
 
432 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.72 
 
 
327 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
274 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  41.74 
 
 
331 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  43.7 
 
 
318 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  44.76 
 
 
452 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  36.75 
 
 
347 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  46.61 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  32.5 
 
 
337 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  49.56 
 
 
325 aa  92.4  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  42.55 
 
 
417 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.7 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  48.89 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  45.71 
 
 
523 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.68 
 
 
372 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
326 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
293 aa  89.4  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
269 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
453 aa  89  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.69 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  36.91 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.43 
 
 
1048 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  42.98 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  48.84 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  45.05 
 
 
400 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  43.1 
 
 
487 aa  87.8  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  34.85 
 
 
391 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
192 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  38.64 
 
 
298 aa  86.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  44.12 
 
 
388 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
192 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.83 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  40.71 
 
 
319 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  44.9 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 
333 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  37.62 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  41.35 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  31.77 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.88 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  43.56 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
181 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  40.38 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.78 
 
 
150 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  38.53 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  42.61 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  37.86 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  40.95 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  41.96 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  41.05 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  40.74 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  44.32 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  42.22 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  37 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>