204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1797 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
180 aa  360  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.59 
 
 
182 aa  94  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.81 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  33.99 
 
 
201 aa  84.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.98 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.56 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  36.6 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.15 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  33.52 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.66 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  36.73 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.93 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  34.25 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.67 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.33 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.37 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.23 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  39.23 
 
 
221 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  35.64 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.89 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.23 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  29.79 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  29.73 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.45 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.18 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.03 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.43 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.88 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.71 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.44 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  28.72 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.18 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.31 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  28.19 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  40.77 
 
 
227 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  36.57 
 
 
215 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  38.41 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  36.84 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.47 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.96 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  30.9 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  34.87 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  38.14 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  39.82 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  31.49 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  29.19 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.45 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  30.3 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.52 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  29.26 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  31.52 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.28 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.42 
 
 
390 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.83 
 
 
206 aa  62  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  30.56 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  48.28 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.39 
 
 
184 aa  61.6  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  26.63 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
218 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.16 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  29.44 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  27.37 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  27.44 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  37.42 
 
 
210 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.72 
 
 
212 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  31.66 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  32.18 
 
 
202 aa  58.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  21.08 
 
 
181 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  32.5 
 
 
223 aa  57.8  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  24.26 
 
 
181 aa  57.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
188 aa  57.4  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  30.37 
 
 
217 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  26.16 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  28 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.46 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.62 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.76 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.78 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  26.32 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  25.68 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.07 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  24.86 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.48 
 
 
210 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25.14 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  29.7 
 
 
193 aa  55.1  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.23 
 
 
188 aa  55.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.42 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>